基因页:ALKBH2
概括?
基因 | 121642 |
象征 | ALKBH2 |
同义词 | ABH2 |
描述 | ALKB同源物2,α-酮戊二酸二加氧酶 |
参考 | MIM:610602|HGNC:HGNC:32487|ENSEMBL:ENSG00000189046|HPRD:14712|Vega:Otthumg00000169246 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q24.11 |
Pascal P值 | 0.027 |
耶和华 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12523276 | CHR5 | 28887555 | ALKBH2 | 121642 | 0.09 | 反式 | ||
RS7195082 | CHR16 | 53584822 | ALKBH2 | 121642 | 0.08 | 反式 | ||
RS2304127 | CHR19 | 56896573 | ALKBH2 | 121642 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ALKBH2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome DNA修复 | 112 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey靶标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DODD鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标需要MYC | 210 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu ezh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |