基因页面:TRAPPC6B
总结吗?
| GeneID | 122553年 |
| 象征 | TRAPPC6B |
| 同义词 | TPC6 |
| 描述 | 贩卖蛋白质粒子复6 b |
| 参考 | MIM: 610397|HGNC: HGNC: 23066|运用:ENSG00000182400|HPRD: 18221|织女:OTTHUMG00000140259 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 14 q21.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.529 |
| 夏洛克假定值 | 0.955 |
| 胎儿β | 0.538 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg22843395 | 14 | 39639820 | TRAPPC6B | 5.67 e-5 | -0.227 | 0.022 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6902183 | chr6 | 121963786 | TRAPPC6B | 122553年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs7132043 | chr12 | 80968399 | TRAPPC6B | 122553年 | 0.12 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PELLICCIOTTA HDAC在抗原表达 | 64年 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |