基因页面:KLHDC1
总结吗?
GeneID | 122773年 |
象征 | KLHDC1 |
同义词 | MST025 |
描述 | kelch域包含1 |
参考 | MIM: 611281|HGNC: HGNC: 19836|运用:ENSG00000197776|HPRD: 13921|织女:OTTHUMG00000140295 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 14 q21.3 |
帕斯卡假定值 | 0.01 |
夏洛克假定值 | 0.478 |
这样假定值 | 8.19的军医 |
胎儿β | -0.919 |
eGene | 小脑半球 |
支持 | CompositeSet |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
KLHDC1 | chr14 | 50159920 . . 50159920 | 行为 | 一个 | NM_172193 | 。 | 移码的 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KLHDC1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ID2下 | 0.88 | 0.49 |
GPR12 | 0.88 | 0.87 |
NFYA | 0.87 | 0.81 |
TBR1 | 0.86 | 0.71 |
PRDM8 | 0.86 | 0.77 |
FEZF2 | 0.85 | 0.76 |
PELI2 | 0.85 | 0.80 |
RP1-21O18.1 | 0.85 | 0.76 |
DAB1 | 0.84 | 0.81 |
KCTD12 | 0.83 | 0.83 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SERPINB6 | -0.49 | -0.64 |
TNFSF12 | -0.46 | -0.65 |
C5orf53 | -0.46 | -0.76 |
HDDC2 | -0.45 | -0.49 |
AP003117.1 | -0.45 | -0.58 |
SLC16A11 | -0.45 | -0.63 |
HEPN1 | -0.45 | -0.70 |
C19orf66 | -0.44 | -0.37 |
FBXO2 | -0.44 | -0.62 |
AIFM3 | -0.44 | -0.74 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
冬天缺氧DN | 52 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN | 805年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺未分化癌DN | 537年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MOLENAAR CCND1和到的目标 | 67年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌H3K9ME3 DN | 120年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王GSK3反应抑制剂SB216763 | 397年 | 206年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN WIERENGA STAT5A目标 | 213年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
黄宗泽TH1细胞毒性模块 | 114年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |