基因页：TC2N
概括？
| 基因 | 123036 |
| 象征 | TC2N |
| 同义词 | C14ORF47 | C2CD1 | MTAC2D1 | TAC2-N |
| 描述 | 串联C2域，核 |
| 参考 | HGNC：HGNC：19859|ENSEMBL：ENSG00000165929|HPRD：11375|Vega：Otthumg00000171121 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 14Q32.12 |
| Pascal P值 | 0.333 |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 伏隔核基底神经节 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS57035593 | 14 | 92268096 | TC2N | ENSG00000165929.8 | 3.15739E-6 | 0.04 | 65784 | gtex_brain_ba24 |
| RS10498631 | 14 | 92268531 | TC2N | ENSG00000165929.8 | 3.15739E-6 | 0.04 | 65349 | gtex_brain_ba24 |
| RS12589636 | 14 | 92287743 | TC2N | ENSG00000165929.8 | 3.15009E-6 | 0.04 | 46137 | gtex_brain_ba24 |
| RS61990092 | 14 | 92289301 | TC2N | ENSG00000165929.8 | 1.48881E-6 | 0.04 | 44579 | gtex_brain_ba24 |
| RS10498632 | 14 | 92290744 | TC2N | ENSG00000165929.8 | 3.14231E-6 | 0.04 | 43136 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C9orf102 | 0.91 | 0.92 |
| KIAA0232 | 0.90 | 0.91 |
| Trip12 | 0.89 | 0.90 |
| GAPVD1 | 0.89 | 0.90 |
| DNAJC13 | 0.89 | 0.90 |
| XPO4 | 0.89 | 0.90 |
| UBR2 | 0.89 | 0.90 |
| Pikfyve | 0.89 | 0.89 |
| myo9a | 0.89 | 0.91 |
| ERCC6 | 0.88 | 0.89 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.70 | -0.71 |
| AF347015.21 | -0.70 | -0.73 |
| AF347015.31 | -0.68 | -0.71 |
| higd1b | -0.68 | -0.72 |
| MT-CO2 | -0.67 | -0.70 |
| ifi27 | -0.66 | -0.69 |
| 增强 | -0.66 | -0.73 |
| AF347015.8 | -0.65 | -0.68 |
| TLCD1 | -0.64 | -0.67 |
| AC021016.1 | -0.64 | -0.64 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chathafe乳腺癌基础与间充质 | 121 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wamunyokoli卵巢癌LMP | 265 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 冷吉非替尼抵抗DN | 230 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标 | 126 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 量缺氧 | 98 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |