基因页:CCR3
概括?
基因 | 1232 |
象征 | CCR3 |
同义词 | CC-CKR-3 | CD193 | CKR3 | CMKBR3 |
描述 | C-C基序趋化因子受体3 |
参考 | MIM:601268|HGNC:HGNC:1604|ENSEMBL:ENSG00000183625|HPRD:03167|Vega:Otthumg00000133484 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21.3 |
Pascal P值 | 0.565 |
胎儿β | 0.053 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CCR3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LTB4R2 | 0.76 | 0.72 |
CPNE2 | 0.69 | 0.68 |
PVRL2 | 0.68 | 0.69 |
AC100793.2 | 0.66 | 0.58 |
NPB | 0.66 | 0.59 |
AC004410.1 | 0.65 | 0.68 |
MZF1 | 0.64 | 0.64 |
DUSP9 | 0.64 | 0.53 |
PAQR7 | 0.63 | 0.64 |
GPR25 | 0.63 | 0.53 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KBTBD3 | -0.39 | -0.45 |
AF347015.27 | -0.37 | -0.37 |
PLA2G4A | -0.37 | -0.39 |
AF347015.31 | -0.37 | -0.38 |
C5orf53 | -0.37 | -0.34 |
ACOT13 | -0.37 | -0.40 |
CA4 | -0.36 | -0.32 |
Rergl | -0.36 | -0.43 |
MT1G | -0.35 | -0.42 |
NRN1 | -0.35 | -0.29 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CCL11 | MGC22554 |Scya11 | 趋化因子(C-C基序)配体11 | - | HPRD,Biogrid | 8609214|8642344 |8676064|9712872 |
CCL13 | CKB10 |MCP-4 |MGC17134 |NCC-1 |NCC1 |Scya13 |scyl1 | 趋化因子(C-C基序)配体13 | - | HPRD,Biogrid | 12149192 |
CCL14 | CC-1 |CC-3 |CKB1 |HCC-1 |HCC-3 |MCIF |NCC-2 |NCC2 |Scya14 |scyl2 | SY14 | 趋化因子(C-C基序)配体14 | - | HPRD,Biogrid | 11085751 |
CCL15 | HCC-2 |HMRP-2B |lkn1 |lkn-1 |MIP-1D |MIP-5 |NCC-3 |NCC3 |Scya15 |scyl3 | SY15 | 趋化因子(C-C基序)配体15 | - | HPRD | 9346309 |
CCL2 | GDCF-2 |HC11 |HSMCR30 |MCAF |MCP-1 |MCP1 |MGC9434 |scya2 |SMC-CF | 趋化因子(C-C基序)配体2 | 重构的复合物 | Biogrid | 8642344 |
CCL24 | CKB-6 |MPIF-2 |mpif2 |SCYA24 | 趋化因子(C-C基序)配体24 | - | HPRD | 12218106 |
CCL26 | imac |MGC126714 |MIP-4A |MIP-4Alpha |Scya26 |TSC-1 | 趋化因子(C-C基序)配体26 | - | HPRD | 10488147 |
CCL28 | CCK1 |mec |MGC71902 |SCYA28 | 趋化因子(C-C基序)配体28 | - | HPRD | 10975800 |
CCL3L1 | 464.2 |D17S1718 |G0S19-2 |LD78 |ld78beta |MGC104178 |MGC12815 |MGC182017 |mip1ap |scya3l | SCYA3L1 | 趋化因子(C-C基序)配体3类样1 | - | HPRD,Biogrid | 11449371 |
CCL5 | D17S136E |MGC17164 |rantes |scya5 |SISD |TCP228 | 趋化因子(C-C基序)配体5 | 重构的复合物 | Biogrid | 8642344|11449371 |
CCL5 | D17S136E |MGC17164 |rantes |scya5 |SISD |TCP228 | 趋化因子(C-C基序)配体5 | - | HPRD | 8642344|9289016 |
CCL7 | fic |马克|MCP-3 |MCP3 |MGC138463 |MGC138465 |NC28 |scya6 |Scya7 | 趋化因子(C-C基序)配体7 | - | HPRD,Biogrid | 8642344 |
CCL8 | HC14 |MCP-2 |MCP2 |Scya10 |Scya8 | 趋化因子(C-C基序)配体8 | - | HPRD | 9005985 |
fgr | FLJ43153 |MGC75096 |src2 |C-FGR |C-SRC2 |p55c-fgr |p58c-fgr | Gardner-Rasheed猫科动物病毒(V-FGR)癌基因同源物 | - | HPRD,Biogrid | 10527858 |
HCK | JTK9 | 血压细胞激酶 | - | HPRD,Biogrid | 10527858 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG趋化因子信号传导途径 | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta CCR3途径 | 23 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta IL5途径 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NKT途径 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽配体结合受体 | 188 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组趋化因子受体结合趋化因子 | 57 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中岛嗜酸性粒细胞 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaurnier PSMD4目标 | 73 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Maekawa ATF2目标 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roessler肝癌转移 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |