概括
基因 1232
象征 CCR3
同义词 CC-CKR-3 | CD193 | CKR3 | CMKBR3
描述 C-C基序趋化因子受体3
参考 MIM:601268|HGNC:HGNC:1604|ENSEMBL:ENSG00000183625|HPRD:03167|Vega:Otthumg00000133484
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.3
Pascal P值 0.565
胎儿β 0.053

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
LTB4R2 0.76 0.72
CPNE2 0.69 0.68
PVRL2 0.68 0.69
AC100793.2 0.66 0.58
NPB 0.66 0.59
AC004410.1 0.65 0.68
MZF1 0.64 0.64
DUSP9 0.64 0.53
PAQR7 0.63 0.64
GPR25 0.63 0.53
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KBTBD3 -0.39 -0.45
AF347015.27 -0.37 -0.37
PLA2G4A -0.37 -0.39
AF347015.31 -0.37 -0.38
C5orf53 -0.37 -0.34
ACOT13 -0.37 -0.40
CA4 -0.36 -0.32
Rergl -0.36 -0.43
MT1G -0.35 -0.42
NRN1 -0.35 -0.29

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CCL11 MGC22554 |Scya11 趋化因子(C-C基序)配体11 - HPRD,Biogrid 8609214|8642344
|8676064|9712872
CCL13 CKB10 |MCP-4 |MGC17134 |NCC-1 |NCC1 |Scya13 |scyl1 趋化因子(C-C基序)配体13 - HPRD,Biogrid 12149192
CCL14 CC-1 |CC-3 |CKB1 |HCC-1 |HCC-3 |MCIF |NCC-2 |NCC2 |Scya14 |scyl2 | SY14 趋化因子(C-C基序)配体14 - HPRD,Biogrid 11085751
CCL15 HCC-2 |HMRP-2B |lkn1 |lkn-1 |MIP-1D |MIP-5 |NCC-3 |NCC3 |Scya15 |scyl3 | SY15 趋化因子(C-C基序)配体15 - HPRD 9346309
CCL2 GDCF-2 |HC11 |HSMCR30 |MCAF |MCP-1 |MCP1 |MGC9434 |scya2 |SMC-CF 趋化因子(C-C基序)配体2 重构的复合物 Biogrid 8642344
CCL24 CKB-6 |MPIF-2 |mpif2 |SCYA24 趋化因子(C-C基序)配体24 - HPRD 12218106
CCL26 imac |MGC126714 |MIP-4A |MIP-4Alpha |Scya26 |TSC-1 趋化因子(C-C基序)配体26 - HPRD 10488147
CCL28 CCK1 |mec |MGC71902 |SCYA28 趋化因子(C-C基序)配体28 - HPRD 10975800
CCL3L1 464.2 |D17S1718 |G0S19-2 |LD78 |ld78beta |MGC104178 |MGC12815 |MGC182017 |mip1ap |scya3l | SCYA3L1 趋化因子(C-C基序)配体3类样1 - HPRD,Biogrid 11449371
CCL5 D17S136E |MGC17164 |rantes |scya5 |SISD |TCP228 趋化因子(C-C基序)配体5 重构的复合物 Biogrid 8642344|11449371
CCL5 D17S136E |MGC17164 |rantes |scya5 |SISD |TCP228 趋化因子(C-C基序)配体5 - HPRD 8642344|9289016
CCL7 fic |马克|MCP-3 |MCP3 |MGC138463 |MGC138465 |NC28 |scya6 |Scya7 趋化因子(C-C基序)配体7 - HPRD,Biogrid 8642344
CCL8 HC14 |MCP-2 |MCP2 |Scya10 |Scya8 趋化因子(C-C基序)配体8 - HPRD 9005985
fgr FLJ43153 |MGC75096 |src2 |C-FGR |C-SRC2 |p55c-fgr |p58c-fgr Gardner-Rasheed猫科动物病毒(V-FGR)癌基因同源物 - HPRD,Biogrid 10527858
HCK JTK9 血压细胞激酶 - HPRD,Biogrid 10527858


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG趋化因子信号传导途径 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CCR3途径 23 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL5途径 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NKT途径 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽配体结合受体 188 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组趋化因子受体结合趋化因子 57 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha I信号事件 195 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR配体结合 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中岛嗜酸性粒细胞 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaurnier PSMD4目标 73 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Maekawa ATF2目标 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因