基因页面:CCR6
总结吗?
| GeneID | 1235年 |
| 象征 | CCR6 |
| 同义词 | BN-1 |碳碳CKR-6 | CC-CKR-6 | CCR-6 | CD196 | CKR-L3 | CKRL3 | CMKBR6 | DCR2 | DRY6 | GPR29 | GPRCY4 | STRL22 |
| 描述 | 主题趋化因子受体6 |
| 参考 | MIM: 601835|HGNC: HGNC: 1607|运用:ENSG00000112486|HPRD: 03498|织女:OTTHUMG00000016015 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6问 |
| 帕斯卡假定值 | 0.284 |
| 胎儿β | -1.118 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PheWAS
简历:PheWAS| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs3093024 | 6 | 167532793 | 零 | 1.499 | CCR6 | 零 | |
| rs3093023 | 6 | 167534290 | 零 | 1.489 | CCR6 | 零 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| STARD9 | 0.54 | 0.54 |
| RAD52 | 0.51 | 0.53 |
| PABPC1L | 0.51 | 0.45 |
| PAN2 | 0.51 | 0.54 |
| CEP152 | 0.50 | 0.50 |
| RTTN | 0.50 | 0.48 |
| GUSB | 0.50 | 0.50 |
| FANCA | 0.50 | 0.46 |
| FSCN3 | 0.50 | 0.40 |
| MYO9B | 0.50 | 0.53 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.32 | -0.36 |
| IL32 | -0.31 | -0.41 |
| MYL3 | -0.31 | -0.36 |
| IFI27 | -0.30 | -0.34 |
| MT-CO2 | -0.30 | -0.33 |
| GNG11 | -0.29 | -0.34 |
| CXCL14 | -0.29 | -0.35 |
| RERGL | -0.29 | -0.41 |
| HIGD1B | -0.29 | -0.34 |
| AF347015.21 | -0.28 | -0.39 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004872 | 受体的活动 | 助教 | 9186513 | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0004945 | 血管紧张素II型受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016493 | 碳碳趋化因子受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007204 | 海拔的胞质钙离子浓度 | 助教 | 9223454 | |
| 去:0007186 | g蛋白耦合受体蛋白信号通路 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006968 | 细胞防御反应 | 助教 | 10521347 | |
| 去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 9186513 | |
| 去:0006959 | 体液免疫反应 | 助教 | 11001880 | |
| 去:0006935 | 趋化性 | 助教 | 11001880 | |
| 去:0006928 | 细胞运动 | 助教 | 9186513 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 助教 | 9186513 | |
| 去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 9186513 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG细胞因子细胞因子受体的相互作用 | 267年 | 161年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG趋化因子信号通路 | 190年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME DEFENSINS | 51 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOMEβDEFENSINS | 42 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME肽配体受体有约束力 | 188年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME类A1受体等视紫红质 | 305年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME趋化因子受体结合趋化因子 | 57 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 我REACTOME Gα信号事件 | 195年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR配体结合 | 408年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME先天免疫系统 | 279年 | 178年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME免疫系统 | 933年 | 616年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 武田的目标NUP98 HOXA9融合10 d | 194年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 武田的目标NUP98 HOXA9融合16 d | 175年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1单核细胞融合DN | 54 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FUNG IL2信号2 | 12 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FUNG和STAT5 IL2目标结合位点T1 | 9 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 赛尔维拉SDHB目标1的DN | 38 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOREAUX TACI了多发性骨髓瘤 | 412年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 徐CREBBP DN的目标 | 44 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 亨德瑞SMARCA4 DN的目标 | 53 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| OSADA ASCL1目标了 | 46 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌等正常 | 476年 | 285年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KUROZUMI应对ONCOCYTIC病毒 | 44 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆EZH2 DN的目标 | 414年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯米尔诺夫红外反应2小时DN | 55 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯米尔诺夫红外反应6小时DN | 114年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |