概括
基因 123606
象征 NIPA1
同义词 FSP3 | SPG6
描述 未印象在Prader-Willi/Angelman综合征1
参考 MIM:608145|HGNC:HGNC:17043|ENSEMBL:ENSG00000170113|HPRD:10487|Vega:Otthumg00000129099
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q11.2
Pascal P值 0.025
胎儿β -1.072

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TMEM70 0.71 0.65
AC023598.3 0.68 0.67
NDUFAF1 0.66 0.64
乌罗斯 0.66 0.66
NDUFV2 0.65 0.69
Sergef 0.65 0.62
UQCRFSL1 0.65 0.59
MDH1 0.64 0.67
C8orf38 0.63 0.60
DNAJC19 0.63 0.64
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.18 -0.41 -0.12
AC010300.1 -0.41 -0.27
AC100783.1 -0.39 -0.26
IL4R -0.39 -0.28
Caskin2 -0.39 -0.36
mtss1l -0.38 -0.36
PXN -0.38 -0.39
SMTN -0.38 -0.39
EDN1 -0.37 -0.21
NFKBIA -0.37 -0.31

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 79 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移DN 121 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild E2F3致癌特征 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克拉斯的iwanaga致癌作用 170 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 114 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤D 89 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向DN 242 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因