基因页:NIPA1
概括?
基因 | 123606 |
象征 | NIPA1 |
同义词 | FSP3 | SPG6 |
描述 | 未印象在Prader-Willi/Angelman综合征1 |
参考 | MIM:608145|HGNC:HGNC:17043|ENSEMBL:ENSG00000170113|HPRD:10487|Vega:Otthumg00000129099 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q11.2 |
Pascal P值 | 0.025 |
胎儿β | -1.072 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NIPA1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TMEM70 | 0.71 | 0.65 |
AC023598.3 | 0.68 | 0.67 |
NDUFAF1 | 0.66 | 0.64 |
乌罗斯 | 0.66 | 0.66 |
NDUFV2 | 0.65 | 0.69 |
Sergef | 0.65 | 0.62 |
UQCRFSL1 | 0.65 | 0.59 |
MDH1 | 0.64 | 0.67 |
C8orf38 | 0.63 | 0.60 |
DNAJC19 | 0.63 | 0.64 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.41 | -0.12 |
AC010300.1 | -0.41 | -0.27 |
AC100783.1 | -0.39 | -0.26 |
IL4R | -0.39 | -0.28 |
Caskin2 | -0.39 | -0.36 |
mtss1l | -0.38 | -0.36 |
PXN | -0.38 | -0.39 |
SMTN | -0.38 | -0.39 |
EDN1 | -0.37 | -0.21 |
NFKBIA | -0.37 | -0.31 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 | 79 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌转移DN | 121 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild E2F3致癌特征 | 246 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克拉斯的iwanaga致癌作用 | 170 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk精子 | 114 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤D | 89 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |