基因页:whamm
概括?
基因 | 123720 |
象征 | whamm |
同义词 | WHAMM1 | WHDC1 |
描述 | 是与肌动蛋白,高尔基膜和微管相关的蛋白质同源物 |
参考 | MIM:612393|HGNC:HGNC:30493| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q25.2 |
Pascal P值 | 0.007 |
Sherlock P值 | 0.926 |
耶和华 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11855735 | CHR15 | 83296544 | whamm | 123720 | 0.17 | 顺式 | ||
RS17158267 | CHR15 | 83497588 | whamm | 123720 | 1.806E-8 | 顺式 | ||
RS1002881 | CHR15 | 83615273 | whamm | 123720 | 0.18 | 顺式 | ||
RS17158132 | CHR15 | 83679705 | whamm | 123720 | 0.01 | 顺式 | ||
RS7690085 | CHR4 | 162708999 | whamm | 123720 | 0.07 | 反式 | ||
RS17158267 | CHR15 | 83497588 | whamm | 123720 | 4.267E-6 | 反式 | ||
RS736718 | CHR16 | 82656424 | whamm | 123720 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/WHAMM_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
王攀登目标DN | 186 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi缺氧 | 140 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |