基因页面:DCUN1D3
总结吗?
GeneID | 123879年 |
象征 | DCUN1D3 |
同义词 | 44 m2.4 | SCCRO3 |
描述 | 缺陷在cullin neddylation 1域包含3 |
参考 | MIM: 616167|HGNC: HGNC: 28734|HPRD: 14660| |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 p12.3 |
帕斯卡假定值 | 0.036 |
胎儿β | 0.358 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.01775 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg01626569 | 16 | 20911881 | LYRM1; DCUN1D3 | 2.253的军医 | -0.316 | 0.036 | DMG: Wockner_2014 |
cg06266962 | 16 | 20871424 | DCUN1D3 | 5.933的军医 | -0.347 | 0.05 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs606565 | chr8 | 90615792 | DCUN1D3 | 123879年 | 0.1 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DCUN1D3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 | 579年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼肿瘤分化和管理不善的DN | 382年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DURCHDEWALD皮肤致癌DN | 264年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
桑塞姆APC MYC目标 | 217年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌DN | 540年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织DN | 274年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WHITFIELD细胞周期年代 | 162年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RAO受SALL4同种型B | 517年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LIM乳腺干细胞 | 489年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG 3班是暂时性的EGF引起的 | 222年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
let-7/98 | 820年 | 827年 | 1、m8 | hsa-let-7a大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
hsa-let-7b大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU | ||||
hsa-let-7c大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU | ||||
hsa-let-7d大脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
hsa-let-7e大脑 | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU | ||||
hsa-let-7f大脑 | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU | ||||
hsa - mir - 98大脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
hsa-let-7g深圳 | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU | ||||
hsa-let-7i大脑 | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU | ||||
mir - 101 | 460年 | 466年 | m8 | hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
miR-132/212 | 547年 | 553年 | 1 | hsa - mir - 212深圳 | UAACAGUCUCCAGUCACGGCC |
hsa - mir - 132大脑 | UAACAGUCUACAGCCAUGGUCG | ||||
miR-141/200a | 539年 | 546年 | 1、m8 | hsa - mir - 141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
hsa - mir - 200 a | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
mir - 145 | 1716年 | 1722年 | 1 | hsa - mir - 145 | GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCUU |
mir - 155 | 562年 | 568年 | 1 | hsa - mir - 155 | UUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGG |
miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 163年 | 169年 | m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
mir - 182 | 1118年 | 1124年 | 1 | hsa - mir - 182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA |
miR-19 | 291年 | 297年 | 1 | hsa-miR-19a | UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA |
hsa-miR-19b | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
mir - 203.1 | 707年 | 713年 | 1 | hsa - mir - 203 | UGAAAUGUUUAGGACCACUAG |
miR-204/211 | 1778年 | 1785年 | 1、m8 | hsa - mir - 204大脑 | UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU |
hsa - mir - 211 | UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU | ||||
miR-30-5p | 1266年 | 1272年 | 1 | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG | ||||
hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
mir - 320 | 1600年 | 1606年 | m8 | hsa - mir - 320 | AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA |
mir - 329 | 465年 | 471年 | 1 | hsa - mir - 329大脑 | AACACACCUGGUUAACCUCUUU |
mir - 335 | 586年 | 592年 | m8 | hsa - mir - 335大脑 | UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUGU |
mir - 338 | 832年 | 838年 | 1 | hsa - mir - 338大脑 | UCCAGCAUCAGUGAUUUUGUUGA |
mir - 381 | 121年 | 127年 | m8 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
mir - 495 | 1221年 | 1227年 | 1 | hsa - mir - 495大脑 | AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU |
mir - 96 | 1118年 | 1124年 | 1 | hsa - mir - 96大脑 | UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC |