基因页：9月2日
概括？
| 基因 | 124404 |
| 象征 | 9月2日 |
| 同义词 | SPGF10 |
| 描述 | 9月12日 |
| 参考 | MIM：611562|HGNC：HGNC：26348|ENSEMBL：ENSG00000140623|HPRD：08061|Vega：Otthumg00000129481 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16p13.3 |
| Pascal P值 | 0.02 |
| 耶和华 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS930854 | CHR16 | 4864100 | 9月2日 | 124404 | 0.02 | 顺式 | ||
| RS930855 | CHR16 | 4864178 | 9月2日 | 124404 | 0.07 | 顺式 | ||
| RS12446456 | CHR16 | 4922200 | 9月2日 | 124404 | 0.05 | 顺式 | ||
| RS11076856 | CHR16 | 4949814 | 9月2日 | 124404 | 0.1 | 顺式 | ||
| RS17572651 | CHR1 | 218943612 | 9月2日 | 124404 | 0.01 | 反式 | ||
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | 9月2日 | 124404 | 3.889E-5 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | 9月2日 | 124404 | 0.02 | 反式 | ||
| RS6803246 | CHR3 | 21826682 | 9月2日 | 124404 | 0.02 | 反式 | ||
| RS2860636 | CHR3 | 21831473 | 9月2日 | 124404 | 0.02 | 反式 | ||
| RS2334911 | CHR3 | 140146463 | 9月2日 | 124404 | 0.13 | 反式 | ||
| RS7635430 | CHR3 | 180152035 | 9月2日 | 124404 | 0.05 | 反式 | ||
| RS17762315 | CHR5 | 76807576 | 9月2日 | 124404 | 0 | 反式 | ||
| RS7729096 | CHR5 | 76835927 | 9月2日 | 124404 | 0.09 | 反式 | ||
| RS10491487 | CHR5 | 80323367 | 9月2日 | 124404 | 0.15 | 反式 | ||
| RS1368303 | CHR5 | 147672388 | 9月2日 | 124404 | 0 | 反式 | ||
| RS17722411 | CHR7 | 43063443 | 9月2日 | 124404 | 0.02 | 反式 | ||
| RS17722435 | CHR7 | 43066121 | 9月2日 | 124404 | 0.1 | 反式 | ||
| RS11563338 | CHR7 | 89985774 | 9月2日 | 124404 | 0.19 | 反式 | ||
| RS17079498 | CHR8 | 3018343 | 9月2日 | 124404 | 0 | 反式 | ||
| RS11139334 | CHR9 | 84209393 | 9月2日 | 124404 | 0.02 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | 9月2日 | 124404 | 2.849e-12 | 反式 | ||
| SNP_A-1830894 | 0 | 9月2日 | 124404 | 0.19 | 反式 | |||
| RS12444397 | 16 | 4821698 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 6.222e-8 | 0 | 16557 | gtex_brain_ba24 |
| RS3747608 | 16 | 4838617 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.563E-7 | 0 | -362 | gtex_brain_ba24 |
| RS72633270 | 16 | 4843059 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 3.316E-7 | 0 | -4804 | gtex_brain_ba24 |
| RS1982514 | 16 | 4845532 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 8.672e-11 | 0 | -7277 | gtex_brain_ba24 |
| RS2075465 | 16 | 4846068 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 8.459E-9 | 0 | -7813 | gtex_brain_ba24 |
| RS62036088 | 16 | 4846336 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 3.58e-7 | 0 | -8081 | gtex_brain_ba24 |
| RS56400014 | 16 | 4846533 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.409E-11 | 0 | -8278 | gtex_brain_ba24 |
| RS9932706 | 16 | 4846854 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.165E-9 | 0 | -8599 | gtex_brain_ba24 |
| RS8118 | 16 | 4847169 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.277E-12 | 0 | -8914 | gtex_brain_ba24 |
| RS7546 | 16 | 4847317 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 3.563e-11 | 0 | -9062 | gtex_brain_ba24 |
| RS1982515 | 16 | 4847524 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.405e-12 | 0 | -9269 | gtex_brain_ba24 |
| RS8053790 | 16 | 4848494 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 4.046E-9 | 0 | -10239 | gtex_brain_ba24 |
| RS56196587 | 16 | 4848996 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 3.064e-8 | 0 | -10741 | gtex_brain_ba24 |
| RS7191123 | 16 | 4849471 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 5.507E-8 | 0 | -11216 | gtex_brain_ba24 |
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| RS3827528 | 16 | 4853092 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.453E-8 | 0 | -14837 | gtex_brain_ba24 |
| RS8064024 | 16 | 4855279 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 7.861e-9 | 0 | -17024 | gtex_brain_ba24 |
| RS11865805 | 16 | 4859591 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 3.328e-9 | 0 | -21336 | gtex_brain_ba24 |
| RS930854 | 16 | 4864101 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.755e-9 | 0 | -25846 | gtex_brain_ba24 |
| RS930855 | 16 | 4864179 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.742E-9 | 0 | -25924 | gtex_brain_ba24 |
| RS1966897 | 16 | 4867124 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 4.673E-9 | 0 | -28869 | gtex_brain_ba24 |
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| RS2075467 | 16 | 4873242 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 4.675E-9 | 0 | -34987 | gtex_brain_ba24 |
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| RS11076849 | 16 | 4888304 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.538e-8 | 0 | -50049 | gtex_brain_ba24 |
| RS4141486 | 16 | 4896780 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 5.812E-7 | 0 | -58525 | gtex_brain_ba24 |
| RS2072595 | 16 | 4897153 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 9.146e-8 | 0 | -58898 | gtex_brain_ba24 |
| RS2219271 | 16 | 4898120 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.979E-8 | 0 | -59865 | gtex_brain_ba24 |
| RS1827983 | 16 | 4898517 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 9.06e-8 | 0 | -60262 | gtex_brain_ba24 |
| RS7186142 | 16 | 4900987 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.028E-7 | 0 | -62732 | gtex_brain_ba24 |
| RS73517042 | 16 | 4901688 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 8.156E-7 | 0 | -63433 | gtex_brain_ba24 |
| RS9934930 | 16 | 4902038 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 4.062E-7 | 0 | -63783 | gtex_brain_ba24 |
| RS9935080 | 16 | 4902207 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.088e-7 | 0 | -63952 | gtex_brain_ba24 |
| RS8056889 | 16 | 4903243 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.038e-7 | 0 | -64988 | gtex_brain_ba24 |
| RS28846492 | 16 | 4904248 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.095E-7 | 0 | -65993 | gtex_brain_ba24 |
| RS9923349 | 16 | 4905124 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.088e-7 | 0 | -66869 | gtex_brain_ba24 |
| RS79338890 | 16 | 4905127 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 4.177E-7 | 0 | -66872 | gtex_brain_ba24 |
| RS9745736 | 16 | 4905691 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.3e-7 | 0 | -67436 | gtex_brain_ba24 |
| RS12926178 | 16 | 4905915 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.684E-7 | 0 | -67660 | gtex_brain_ba24 |
| RS966062 | 16 | 4907430 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 9.764e-7 | 0 | -69175 | gtex_brain_ba24 |
| RS3747613 | 16 | 4908504 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 3.031E-8 | 0 | -70249 | gtex_brain_ba24 |
| RS960006 | 16 | 4911195 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.485E-7 | 0 | -72940 | gtex_brain_ba24 |
| RS1395602 | 16 | 4911239 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.486E-7 | 0 | -72984 | gtex_brain_ba24 |
| RS8048709 | 16 | 4913761 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.036E-7 | 0 | -75506 | gtex_brain_ba24 |
| RS35715610 | 16 | 4915699 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.84E-7 | 0 | -77444 | gtex_brain_ba24 |
| RS2063101 | 16 | 4916348 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.038e-7 | 0 | -78093 | gtex_brain_ba24 |
| RS8056320 | 16 | 4918017 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.173E-7 | 0 | -79762 | gtex_brain_ba24 |
| RS3813749 | 16 | 4919127 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.1E-7 | 0 | -80872 | gtex_brain_ba24 |
| RS6500637 | 16 | 4920661 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 9.691E-7 | 0 | -82406 | gtex_brain_ba24 |
| RS2456779 | 16 | 4925817 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.078E-6 | 0 | -87562 | gtex_brain_ba24 |
| RS3185547 | 16 | 4931100 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 9.002E-7 | 0 | -92845 | gtex_brain_ba24 |
| RS5013674 | 16 | 4932470 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.008e-6 | 0 | -94215 | gtex_brain_ba24 |
| RS1049208 | 16 | 4934549 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 9.448e-7 | 0 | -96294 | gtex_brain_ba24 |
| RS2341986 | 16 | 4819496 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.77E-6 | 0 | 18759 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9921972 | 16 | 4821425 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.178E-6 | 0 | 16830 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3747606 | 16 | 4826005 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.267E-7 | 0 | 12250 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6500631 | 16 | 4826705 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.171E-6 | 0 | 11550 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12443659 | 16 | 4834378 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.114E-6 | 0 | 3877 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS75904354 | 16 | 4836155 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.528E-6 | 0 | 2100 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS113531089 | 16 | 4843008 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 6.408E-7 | 0 | -4753 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS72633270 | 16 | 4843059 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 3.4e-7 | 0 | -4804 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1982514 | 16 | 4845532 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 6.922e-7 | 0 | -7277 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2075465 | 16 | 4846068 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.003E-6 | 0 | -7813 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62036088 | 16 | 4846336 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 4.084e-8 | 0 | -8081 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS56400014 | 16 | 4846533 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.667E-8 | 0 | -8278 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9932706 | 16 | 4846854 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 3.054e-7 | 0 | -8599 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8118 | 16 | 4847169 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.063E-8 | 0 | -8914 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7546 | 16 | 4847317 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 7.646E-8 | 0 | -9062 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1982515 | 16 | 4847524 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.884e-8 | 0 | -9269 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS17137286 | 16 | 4852892 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.121E-6 | 0 | -14637 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3827528 | 16 | 4853092 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 8.651E-7 | 0 | -14837 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1966897 | 16 | 4867124 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.285E-7 | 0 | -28869 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2075467 | 16 | 4873242 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 9.975E-7 | 0 | -34987 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7200395 | 16 | 4920412 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.535E-6 | 0 | -82157 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2251666 | 16 | 4923091 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.712E-6 | 0 | -84836 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2456779 | 16 | 4925817 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 7.385e-8 | 0 | -87562 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2660221 | 16 | 4926036 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 4.517E-7 | 0 | -87781 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS200248231 | 16 | 4927796 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 9.213E-7 | 0 | -89541 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1876359 | 16 | 4930100 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.116E-7 | 0 | -91845 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3185547 | 16 | 4931100 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 4.933E-8 | 0 | -92845 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS882235 | 16 | 4931651 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 2.447E-8 | 0 | -93396 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7928 | 16 | 4931958 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 8.027E-7 | 0 | -93703 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS741769 | 16 | 4936205 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 6.653E-7 | 0 | -97950 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2660241 | 16 | 4940023 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 3.603E-8 | 0 | -101768 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2660243 | 16 | 4941397 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.104E-6 | 0 | -103142 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS28375268 | 16 | 4949528 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 1.498E-7 | 0 | -111273 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7193783 | 16 | 4949608 | 9月2日 | ENSG00000140623.9 | 3.418e-7 | 0 | -111353 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Ingram SHH靶向DN | 64 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF LCP带有H3K27ME3 | 70 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |