基因页面:EARS2
总结吗?
GeneID | 124454年 |
象征 | EARS2 |
同义词 | COXPD12 | MSE1 | gluRS |
描述 | glutamyl-tRNA合成酶2,线粒体 |
参考 | MIM: 612799|HGNC: HGNC: 29419|运用:ENSG00000103356|织女:OTTHUMG00000177018 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 p12.2 |
帕斯卡假定值 | 0.083 |
胎儿β | -0.081 |
eGene | 皮质 额叶皮质BA9 海马体 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 | |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.01775 | |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
EARS2 | chr16 | 23546654 | G | 一个 | NM_001083614 NR_003501 |
。 。 |
沉默 npcRNA |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs9923234 | 16 | 23554760 | EARS2 | ENSG00000103356.11 | 8.6728 e - | 0.03 | 9684年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EARS2_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004818 | glutamate-tRNA连接酶的活动 | 国际能源机构 | 谷氨酸(术语层面:7) | - - - - - - |
去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004812 | 氨酰连接酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016874 | 连接酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006424 | glutamyl-tRNA氨酰化 | 国际能源机构 | 谷氨酸(术语层面:11) | - - - - - - |
去:0006412 | 翻译 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005739 | 线粒体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005759 | 线粒体基质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG卟啉和叶绿素代谢 | 41 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG氨酰生物合成 | 41 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME线粒体TRNA氨酰化 | 21 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME TRNA氨酰化 | 42 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
魏MIR34A目标 | 148年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼肿瘤分化好与差 | 236年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时DN | 911年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN | 1011年 | 592年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
近藤EZH2的目标 | 245年 | 148年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由喀斯特IWANAGA致癌PTEN DN | 353年 | 226年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 | 280年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |