基因页:ADH1B
概括?
基因 | 125 |
象征 | ADH1B |
同义词 | ADH2 | HEL-S-117 |
描述 | 酒精脱氢酶1B(I类),β多肽 |
参考 | MIM:103720|HGNC:HGNC:250|HPRD:00065| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q23 |
Pascal P值 | 0.445 |
胎儿β | -0.197 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16841037 | CHR1 | 4316543 | ADH1B | 125 | 0.03 | 反式 | ||
RS17775722 | Chr9 | 26199256 | ADH1B | 125 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ADH1B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
hnrnpc | 0.93 | 0.89 |
RBBP4 | 0.92 | 0.89 |
GNAI3 | 0.91 | 0.81 |
UBA2 | 0.91 | 0.87 |
CPNE3 | 0.90 | 0.81 |
ASF1A | 0.90 | 0.82 |
CPSF3 | 0.90 | 0.85 |
clns1a | 0.90 | 0.85 |
Med28 | 0.90 | 0.86 |
NPM1 | 0.89 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.33 | -0.59 | -0.74 |
AF347015.27 | -0.58 | -0.71 |
MT-CO2 | -0.58 | -0.71 |
AF347015.8 | -0.58 | -0.72 |
mt-cyb | -0.56 | -0.70 |
AF347015.15 | -0.55 | -0.70 |
AF347015.26 | -0.55 | -0.70 |
SLC9A3R2 | -0.55 | -0.54 |
tinagl1 | -0.54 | -0.64 |
HLA-F | -0.54 | -0.63 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004024 | 酒精脱氢酶活性,锌依赖性 | 塔斯 | 9982 | |
去:0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 艾达 | 9982 | |
去:0009055 | 电子载体活动 | 塔斯 | 2398055 | |
GO:0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006069 | 乙醇氧化 | 塔斯 | 2398055 | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG糖酵解糖异生 | 62 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg脂肪酸代谢 | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg酪氨酸代谢 | 42 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg视黄醇代谢 | 64 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
细胞色素P450的异种生物的KEGG代谢 | 70 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG药物代谢细胞色素P450 | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Phase1化合物的功能化 | 70 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组乙醇氧化 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质标记DN | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房导管癌与小叶正常DN | 69 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanharanta子宫肌瘤DN | 67 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tang衰老TP53靶向DN | 57 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时DN | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 8小时DN | 53 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部DN | 128 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼中的Smid乳腺癌复发 | 97 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺DN中的Smid乳腺癌复发 | 37 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌腔 | 84 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜DN | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Woo肝癌复发DN | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹间皮瘤总体生存率 | 7 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹间皮瘤生存 | 11 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA2 DN | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染2小时 | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |