基因页面:CLDND2
总结吗?
| GeneID | 125875年 |
| 象征 | CLDND2 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | claudin域包含2 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 28511|运用:ENSG00000160318|HPRD: 14574|织女:OTTHUMG00000182901 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 19 q13.41 |
| 帕斯卡假定值 | 0.17 |
| 夏洛克假定值 | 1.703的军医 |
| 胎儿β | -0.261 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG: vanEijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括432个不同甲基化CpG网站对应391精神分裂症患者之间独特的成绩单(n = 260)和对照组(n = 250)的影响。 | 5 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg16293105 | 19 | 52034970 | CLDND2 | 3.416的军医 | 9.585 | DMG: vanEijk_2014 | |
| cg08818784 | 19 | 56562184 - 56562207 | CLDND2 | 1.166的军医 | 9.03 | DMG: vanEijk_2014 | |
| cg12491710 | 19 | 51891526 | CLDND2 | 0.001 | -5.257 | DMG: vanEijk_2014 | |
| cg13407883 | 19 | 51627843 | CLDND2 | 0.001 | -9.88 | DMG: vanEijk_2014 | |
| cg14496375 | 19 | 51872365 | CLDND2 | 2.13 e - | -12.935 | DMG: vanEijk_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1990542 | chr2 | 59380755 | CLDND2 | 125875年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs17082952 | chr4 | 63704150 | CLDND2 | 125875年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs17140817 | chr7 | 69161094 | CLDND2 | 125875年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs10256512 | chr7 | 69179729 | CLDND2 | 125875年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs10230356 | chr7 | 69259612 | CLDND2 | 125875年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs2029585 | chr12 | 100442386 | CLDND2 | 125875年 | 0.15 | 反式 | ||
| rs10498563 | chr14 | 83962834 | CLDND2 | 125875年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs9615635 | chr22 | 48181619 | CLDND2 | 125875年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs12840601 | chrX | 90356935 | CLDND2 | 125875年 | 0.02 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 布鲁克纳MIRLET7A3的目标 | 111年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆EZH2的目标了 | 295年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 菲格罗亚AML甲基化集群5 DN | 50 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |