Summary
基因 1268
象征 CNR1
同义词 CANN6|CB-R|CB1|CB1A|CB1K5|CB1R|CNR
描述 大麻素受体1(脑)
Reference MIM:114610|HGNC:HGNC:2159|ENSEMBL:ENSG00000118432|HPRD:00259|Vega:Otthumg0000000015184
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6q14-q15
Pascal P值 0.167
胎儿β 0.583
主持人 Myers' cis & trans
支持 CANABINOID
GPCR信号传导

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008), association studies 2 链接到Szgene
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献:0.0036

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12367145 CHR12 95300075 CNR1 1268 0.17 反式
RS7306940 CHR12 95308092 CNR1 1268 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Col1a2 0.94 0.84
COL3A1 0.92 0.81
COL6A3 0.91 0.77
IGF2 0.89 0.73
NID2 0.87 0.49
PCOLCE 0.87 0.73
ALX4 0.86 0.47
OSR1 0.86 0.49
NID1 0.85 0.57
SLC6A4 0.85 0.47
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
皮尔 -0.31 -0.23
S100A1 -0.30 -0.15
SEPT4 -0.30 -0.24
CSRP1 -0.28 -0.10
CYP2J2 -0.28 -0.13
AF347015.33 -0.28 -0.16
HLA-F -0.28 -0.06
C5orf53 -0.28 -0.15
plekhb1 -0.28 -0.12
RGN -0.28 -0.14

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0004872 受体活性 IEA -
去:0004949 cannabinoid receptor activity TAS 1718258
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007187 G-protein signaling, coupled to cyclic nucleotide second messenger TAS 1718258
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0007610 行为 TAS 1718258
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005886 质膜 TAS 1718258
去:0005887 integral to plasma membrane TAS 1718258

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID NCADHERIN PATHWAY 33 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME SIGNALING BY GPCR 920 449 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME GPCR DOWNSTREAM SIGNALING 805 368 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome G alpha I信号事件 195 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome GPCR配体结合 408 246 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SENGUPTA NASOPHARYNGEAL CARCINOMA WITH LMP1 UP 408 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HUTTMANN B CLL POOR SURVIVAL UP 276 187 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1签名3 341 197 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee神经Crest干细胞向上 146 99 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 60 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAX3 FOXO1融合DN的Ebauer目标 48 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LUI甲状腺癌簇2 42 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARTORIATI MDM4 TARGETS NEUROEPITHELIUM DN 164 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 All SZGR 2.0 genes in this pathway
pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典DN 59 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Haslinger B Cll,带有11q23删除 23 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan多发性骨髓瘤CD2 45 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
巴索CD40信号传导DN 68 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
康(Kang)由tert dn永生 102 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
牙槽横纹肌肉瘤 98 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAL PRMT5靶向DN 29 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kuninger IGF1与PDGFB的目标 82 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RIGGINS TAMOXIFEN RESISTANCE DN 220 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
雄鹿癌俯卧反应E2 28 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础DN 701 446 All SZGR 2.0 genes in this pathway
植洛小儿所有疗法反应dn 29 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Asgharzadeh神经母细胞瘤生存率差DN 46 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
gregory合成致死与伊马替尼 145 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Servitja Islet HNF1A靶向 163 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
杨Bcl3靶向 364 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LE神经元分化 18 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-128 922 928 M8 海关a-miR-128a ucacagugaaccggucuuuu
海关a-miR-128b ucacagugaaccggucuuc
mir-141/200a 453 459 M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
海关a-miR-200a uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-181 3405 3412 1A,M8 HSA-MIR-181Abrain AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181Cbrain aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181Dbrain aacauucauuguugucggggguggguu
mir-19 1181 1187 1a HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
mir-27 2540 2546 1a HSA-MIR-27Abrain uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27Bbrain uucacaguggcuaaguucugc
mir-29 2512 2518 M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-30-5p 192 198 1a HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
海关a-miR-30cbrain UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
海关a-miR-30dSZ UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir-485-3p 3270 3276 M8 海关a-miR-485-3p gucauacgggcucucucucucucu
miR-494 3610 3617 1A,M8 HSA-MIR-494brain ugaaacauacgggaaaccucuu
miR-495 3697 3703 M8 HSA-MIR-495brain Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-543 3348 3354 1a 海关a-miR-543 aaacauucgcggugcacuucu