基因页面:CNTFR
总结吗?
| GeneID | 1271年 |
| 象征 | CNTFR |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 睫状神经营养因子受体 |
| 参考 | MIM: 118946|HGNC: HGNC: 2170|运用:ENSG00000122756|HPRD: 00348|织女:OTTHUMG00000019821 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 9 p13 |
| 帕斯卡假定值 | 0.045 |
| 夏洛克假定值 | 5.53 e-5 |
| 胎儿β | -0.293 |
| eGene | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs11006200 | chr10 | 52339779 | CNTFR | 1271年 | 0.17 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TNFRSF19 | 0.74 | 0.65 |
| DCT | 0.68 | -0.02 |
| MSTN | 0.67 | 0.29 |
| PDLIM1 | 0.67 | 0.40 |
| NEUROD1 | 0.66 | 0.49 |
| FGFR1 | 0.66 | 0.34 |
| 中行 | 0.65 | 0.42 |
| JUB | 0.64 | 0.43 |
| COL4A6 | 0.63 | 0.60 |
| LTBP1 | 0.63 | 0.29 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.19 | -0.55 |
| MGLL | -0.18 | -0.30 |
| ASPHD1 | -0.18 | -0.45 |
| CCNI2 | -0.18 | -0.46 |
| FBXO2 | -0.18 | -0.41 |
| HLA-F | -0.18 | -0.48 |
| SLC16A11 | -0.18 | -0.41 |
| INPP1 | -0.18 | -0.07 |
| TMEM54 | -0.18 | -0.39 |
| APOL1 | -0.17 | -0.49 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004897 | 睫状神经营养因子受体的活动 | 助教 | 神经营养(术语层面:7) | 7585948 |
| 去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0004896 | 细胞因子受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0019955 | 细胞因子绑定 | 新闻学会 | 15272019 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007399 | 神经系统发育 | 助教 | 神经突(术语层面:5) | 7585948 |
| 去:0007165 | 信号转导 | NAS | 1648265 | |
| 去:0008284 | 积极的调控细胞增殖 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0031225 | 固定在膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0019898 | 外在膜 | 助教 | 1648265 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG细胞因子细胞因子受体的相互作用 | 267年 | 161年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG木菠萝STAT信号通路 | 155年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN血清剥夺了细胞凋亡 | 552年 | 347年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PEDRIOLI MIR31目标了 | 221年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 146 | 611年 | 617年 | 1 | hsa - mir - 146 a | UGAGAACUGAAUUCCAUGGGUU |
| hsa - mir - 146 b大脑 | UGAGAACUGAAUUCCAUAGGCU | ||||
| miR-19 | 82年 | 89年 | 1、m8 | hsa-miR-19a | UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA |
| hsa-miR-19b | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
| mir - 200 bc / 429 | 510年 | 516年 | m8 | hsa - mir - 200 b | UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC |
| hsa - mir - 200 c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
| hsa - mir - 429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||
| mir - 203.1 | 629年 | 635年 | 1 | hsa - mir - 203 | UGAAAUGUUUAGGACCACUAG |
| miR-21 | 392年 | 398年 | m8 | hsa-miR-21大脑 | UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA |
| hsa - mir - 590 | GAGCUUAUUCAUAAAAGUGCAG | ||||
| miR-22 | 219年 | 225年 | 1 | hsa-miR-22大脑 | AAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU |
| miR-24 | 56 | 62年 | m8 | hsa-miR-24深圳 | UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG |
| miR-28 | 395年 | 401年 | m8 | hsa-miR-28大脑 | AAGGAGCUCACAGUCUAUUGAG |
| mir - 370 | 41 | 47 | 1 | hsa - mir - 370大脑 | GCCUGCUGGGGUGGAACCUGG |
| mir - 374 | 389年 | 395年 | 1 | hsa - mir - 374 | UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG |
| mir - 485 - 5 - p | 348年 | 354年 | m8 | hsa - mir - 485 - 5 - p | AGAGGCUGGCCGUGAUGAAUUC |
| mir - 504 | 365年 | 371年 | m8 | hsa - mir - 504 | AGACCCUGGUCUGCACUCUAU |
| miR-9 | 234年 | 241年 | 1、m8 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |