概括
基因 127343
象征 DMBX1
同义词 mbx | OTX3 | PAXB
描述 Diencephalon/Mesencephalon homeobox 1
参考 MIM:607410|HGNC:HGNC:19026|Ensembl:ENSG00000197587|HPRD:07593|Vega:Otthumg00000007982
基因类型 蛋白质编码
地图位置 133
Pascal P值 0.046

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 ISS -
GO:0016564 转录阻遏活性 ISS -
GO:0043565 序列特异性DNA结合 ISS -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007420 大脑发育 ISS 大脑(GO期限:7) -
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
GO:0016481 转录的负调节 ISS -
GO:0048589 发展增长 ISS -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-23 353 359 M8 HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-323 353 359 1a HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu