基因页:DMBX1
概括?
基因 | 127343 |
象征 | DMBX1 |
同义词 | mbx | OTX3 | PAXB |
描述 | Diencephalon/Mesencephalon homeobox 1 |
参考 | MIM:607410|HGNC:HGNC:19026|Ensembl:ENSG00000197587|HPRD:07593|Vega:Otthumg00000007982 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 133 |
Pascal P值 | 0.046 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DMBX1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | ISS | - | |
GO:0016564 | 转录阻遏活性 | ISS | - | |
GO:0043565 | 序列特异性DNA结合 | ISS | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007420 | 大脑发育 | ISS | 大脑(GO期限:7) | - |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
GO:0016481 | 转录的负调节 | ISS | - | |
GO:0048589 | 发展增长 | ISS | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-23 | 353 | 359 | M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-323 | 353 | 359 | 1a | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |