基因页:C1orf87
概括?
基因 | 127795 |
象征 | C1orf87 |
同义词 | 克雷夫 |
描述 | 染色体1开放阅读框87 |
参考 | HGNC:HGNC:28547|ENSEMBL:ENSG00000162598|HPRD:11338|Vega:Otthumg00000008992 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p32.1 |
Pascal P值 | 0.081 |
胎儿β | 0.104 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.02692 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS596985 | CHR1 | 64277034 | C1orf87 | 127795 | 0.05 | 反式 | ||
RS6659821 | CHR1 | 110339827 | C1orf87 | 127795 | 0.03 | 反式 | ||
RS16838771 | CHR1 | 157511227 | C1orf87 | 127795 | 1.057E-4 | 反式 | ||
RS6713473 | CHR2 | 11284414 | C1orf87 | 127795 | 0 | 反式 | ||
RS17019687 | CHR2 | 80972176 | C1orf87 | 127795 | 0.03 | 反式 | ||
RS13412567 | CHR2 | 110457213 | C1orf87 | 127795 | 0.14 | 反式 | ||
RS6413977 | 0 | C1orf87 | 127795 | 0.01 | 反式 | |||
RS4346320 | CHR2 | 142150284 | C1orf87 | 127795 | 0.01 | 反式 | ||
RS7565413 | CHR2 | 142151284 | C1orf87 | 127795 | 0.01 | 反式 | ||
RS12633404 | CHR3 | 80381837 | C1orf87 | 127795 | 0.16 | 反式 | ||
RS9882567 | CHR3 | 188988929 | C1orf87 | 127795 | 0.02 | 反式 | ||
RS10075513 | CHR5 | 117091552 | C1orf87 | 127795 | 0.17 | 反式 | ||
RS6900976 | CHR6 | 721998 | C1orf87 | 127795 | 0.15 | 反式 | ||
RS9397728 | CHR6 | 150514248 | C1orf87 | 127795 | 0.01 | 反式 | ||
RS17694984 | CHR8 | 1844909 | C1orf87 | 127795 | 0.16 | 反式 | ||
RS16908145 | CHR8 | 139037972 | C1orf87 | 127795 | 0.07 | 反式 | ||
RS10958892 | Chr9 | 10125117 | C1orf87 | 127795 | 0.07 | 反式 | ||
RS10958896 | Chr9 | 10126894 | C1orf87 | 127795 | 0.02 | 反式 | ||
RS10958899 | Chr9 | 10128700 | C1orf87 | 127795 | 3.131E-4 | 反式 | ||
RS10958907 | Chr9 | 10131580 | C1orf87 | 127795 | 4.05e-4 | 反式 | ||
RS1322159 | Chr9 | 10132695 | C1orf87 | 127795 | 2.875E-4 | 反式 | ||
RS11044062 | CHR12 | 8371319 | C1orf87 | 127795 | 0.15 | 反式 | ||
RS2297479 | CHR12 | 125591249 | C1orf87 | 127795 | 0.07 | 反式 | ||
RS11656351 | CHR17 | 9489574 | C1orf87 | 127795 | 0.01 | 反式 | ||
RS236517 | CHR17 | 68275174 | C1orf87 | 127795 | 0.15 | 反式 | ||
RS11080561 | CHR18 | 12257229 | C1orf87 | 127795 | 0.03 | 反式 | ||
RS16951170 | CHR18 | 47402487 | C1orf87 | 127795 | 0.01 | 反式 | ||
RS16962554 | CHR19 | 29590544 | C1orf87 | 127795 | 0 | 反式 | ||
RS7268640 | CHR20 | 47150267 | C1orf87 | 127795 | 1.412E-8 | 反式 | ||
RS1883665 | Chrx | 17650382 | C1orf87 | 127795 | 0 | 反式 | ||
RS7062071 | Chrx | 17724830 | C1orf87 | 127795 | 2.333E-6 | 反式 | ||
RS7879274 | Chrx | 145592957 | C1orf87 | 127795 | 0.05 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/C1orf87_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由SALL4同工型绑定的RAO A | 182 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |