概括
基因 127795
象征 C1orf87
同义词 克雷夫
描述 染色体1开放阅读框87
参考 HGNC:HGNC:28547|ENSEMBL:ENSG00000162598|HPRD:11338|Vega:Otthumg00000008992
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p32.1
Pascal P值 0.081
胎儿β 0.104
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02692

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS596985 CHR1 64277034 C1orf87 127795 0.05 反式
RS6659821 CHR1 110339827 C1orf87 127795 0.03 反式
RS16838771 CHR1 157511227 C1orf87 127795 1.057E-4 反式
RS6713473 CHR2 11284414 C1orf87 127795 0 反式
RS17019687 CHR2 80972176 C1orf87 127795 0.03 反式
RS13412567 CHR2 110457213 C1orf87 127795 0.14 反式
RS6413977 0 C1orf87 127795 0.01 反式
RS4346320 CHR2 142150284 C1orf87 127795 0.01 反式
RS7565413 CHR2 142151284 C1orf87 127795 0.01 反式
RS12633404 CHR3 80381837 C1orf87 127795 0.16 反式
RS9882567 CHR3 188988929 C1orf87 127795 0.02 反式
RS10075513 CHR5 117091552 C1orf87 127795 0.17 反式
RS6900976 CHR6 721998 C1orf87 127795 0.15 反式
RS9397728 CHR6 150514248 C1orf87 127795 0.01 反式
RS17694984 CHR8 1844909 C1orf87 127795 0.16 反式
RS16908145 CHR8 139037972 C1orf87 127795 0.07 反式
RS10958892 Chr9 10125117 C1orf87 127795 0.07 反式
RS10958896 Chr9 10126894 C1orf87 127795 0.02 反式
RS10958899 Chr9 10128700 C1orf87 127795 3.131E-4 反式
RS10958907 Chr9 10131580 C1orf87 127795 4.05e-4 反式
RS1322159 Chr9 10132695 C1orf87 127795 2.875E-4 反式
RS11044062 CHR12 8371319 C1orf87 127795 0.15 反式
RS2297479 CHR12 125591249 C1orf87 127795 0.07 反式
RS11656351 CHR17 9489574 C1orf87 127795 0.01 反式
RS236517 CHR17 68275174 C1orf87 127795 0.15 反式
RS11080561 CHR18 12257229 C1orf87 127795 0.03 反式
RS16951170 CHR18 47402487 C1orf87 127795 0.01 反式
RS16962554 CHR19 29590544 C1orf87 127795 0 反式
RS7268640 CHR20 47150267 C1orf87 127795 1.412E-8 反式
RS1883665 Chrx 17650382 C1orf87 127795 0 反式
RS7062071 Chrx 17724830 C1orf87 127795 2.333E-6 反式
RS7879274 Chrx 145592957 C1orf87 127795 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因