SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因ID	1278
Symbol	COL1A2
同义词	OI4
描述	胶原型I alpha 2
参考	MIM:120160\|HGNC：HGNC：2198\|Ensembl:ENSG00000164692\|HPRD：00363\|Vega：Otthumg00000148675
基因type	protein-coding
地图位置	7Q22.1
Pascal P值	0.01
eGene	迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因

基因集名称	基因组方法	描述	Info
CV：GWASDB	全基因组关联研究	gwasdbrecords for schizophrenia
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

EQTL注释

SNP ID	Chromosome	Position	eGene	基因Entrez ID	PVALUE	qvalue	TSS distance	eQTL type
rs10994209	Chr10	61877705	COL1A2	1278		0.14		trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
NPC1	0.85	0.79
SEMA4D	0.84	0.82
PCSK6	0.84	0.74
USP54	0.83	0.75
LASS2	0.83	0.82
TTYH2	0.83	0.82
C11orf9	0.82	0.70
PRR5L	0.81	0.84
JAM3	0.81	0.75
GLTP	0.81	0.80

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
ST20	-0.38	-0.48
AC174470.1	-0.37	-0.43
MED19	-0.37	-0.44
TCTEX1D2	-0.36	-0.42
SCNM1	-0.35	-0.43
纳米3	-0.35	-0.47
C1orf86	-0.35	-0.40
TBC1D10A	-0.35	-0.35
COMTD1	-0.35	-0.38
RPL35	-0.34	-0.48

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
APP	AAA \| ABETA \| ABPP \| AD1 \| APPI \| CTFgamma \| CVAP \| PN2	amyloid beta (A4) precursor protein	-	HPRD	7688497
BGN	DSPG1 \|PG-S1 \|PGI \|slr1a	大扫描	-	HPRD	7852349
CD36	CHDS7 \|脂肪\|gp3b \|GP4 \|GPIV \|帕西夫\|Scarb3	CD36molecule (thrombospondin receptor)	-	HPRD，Biogrid	10772928
CD44	CDW44 \| CSPG8 \| ECMR-III \| HCELL \| IN \| LHR \| MC56 \| MDU2 \| MDU3 \| MGC10468 \| MIC4 \| MUTCH-I \| Pgp1	CD44molecule (Indian blood group)	-	HPRD	1730778
CD93	C1QR1 \|C1QR（P）\|C1QRP \|CDW93 \|mxra4 \|DJ737E23.1	CD93分子	-	HPRD	1377218
COL5A3	-	collagen, type V, alpha 3	-	HPRD	6501291\|7346227 \|10722718
COL5A3	-	collagen, type V, alpha 3	体内	BioGRID	6501291\|10722718
DCN	CSCD \| DSPG2 \| PG40 \| PGII \| PGS2 \| SLRR1B	装饰	-	HPRD，Biogrid	1468447\|2375748 \|9675033
FN1	CIG \|DKFZP686F10164 \|DKFZP686H0342 \|DKFZP686I1370 \|DKFZP686O13149 \|ed-b \|Finc \|fn \|fnz \|gfnd \| GFND2 \| LETS \| MSF	fibronectin 1	-	HPRD，Biogrid	8468356
ITGA2	BR \| CD49B \| GPIa \| VLA-2 \| VLAA2	整合素，α2（CD49B，alpha 2 vla-2受体的亚基）	-	HPRD	2156854
ITGA2B	CD41 \|CD41B \|gp2b \|gpiib \|GTA \|HPA3	integrin, alpha 2b (platelet glycoprotein IIb of IIb/IIIa complex, antigen CD41)	-	HPRD，Biogrid	11359786
lum	LDC \| SLRR2D	Lumican	-	HPRD	10734230
MMP9	clg4b \|凝胶\|MMP-9	matrix metallopeptidase 9 (gelatinase B, 92kDa gelatinase, 92kDa type IV collagenase)	-	HPRD，Biogrid	9878537
P4HB	DSI \| ERBA2L \| GIT \| PDI \| PDIA1 \| PHDB \| PO4DB \| PO4HB \| PROHB	procollagen-proline, 2-oxoglutarate 4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), beta polypeptide	-	HPRD，Biogrid	10329688
SPARC	ON	secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)	-	HPRD	7034958
TGFBI	Bigh3 \|CDB1 \|CDG2 \|CDGG1 \|CSD \|CSD1 \|CSD2 \|CSD3 \|EBMD \|LCD1	转化生长因子，β诱导的68KDA	-	HPRD，Biogrid	11867580\|12034705
VWF	f8vwf \|vwd	von Willebrand factor	-	HPRD	3490481

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
KEGG FOCAL ADHESION	201	138	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ECM RECEPTOR INTERACTION	84	53	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SMAD2 3NUCLEAR PATHWAY	82	63	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ENDOTHELIN PATHWAY	63	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID INTEGRIN1 PATHWAY	66	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL4 2 Pathway	65	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID INTEGRIN3 PATHWAY	43	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FRA PATHWAY	37	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3整合素途径	75	53	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AP1途径	70	60	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CMYB PATHWAY	84	61	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SYNDECAN 1 PATHWAY	46	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid myc抑制道路	63	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID淋巴血管生成途径	25	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学	396	292	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞外基质组织	87	42	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL SURFACE INTERACTIONS AT THE VASCULAR WALL	91	65	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME COLLAGEN FORMATION	58	31	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组血小板粘附于暴露的胶原蛋白	12	8	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTEGRIN CELL SURFACE INTERACTIONS	79	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PDGF的Reactome信号传导	122	93	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GPVI MEDIATED ACTIVATION CASCADE	31	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME AXON GUIDANCE	251	188	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NCAM1 INTERACTIONS	39	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NCAM SIGNALING FOR NEURITE OUT GROWTH	64	49	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血	466	331	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION	208	138	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA CANCER MICROENVIRONMENT UP	26	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL UP	285	181	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤	205	140	该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放射疗法反应性DN	92	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN	481	290	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP	783	507	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE UP	351	230	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌	294	178	该途径中的所有SZGR 2.0基因
钟对偶氮替丁的反应和tsa	183	119	该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与导管正常	44	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST DUCTAL CARCINOMA VS LOBULAR NORMAL UP	73	50	该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与导管正常	69	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN	74	42	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WILCOX RESPONSE TO PROGESTERONE DN	66	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VECCHI GASTRIC CANCER ADVANCED VS EARLY UP	175	120	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN NPM1 SIGNATURE 3 UP	341	197	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION MONOCYTE UP	204	140	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION ERYTHROCYTE UP	157	104	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞向上	146	99	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN	1375	806	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION KRAS DN	142	95	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEBOTAEV GR TARGETS DN	120	73	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN	1781年	1082	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN	394	258	该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马恶性皮肤肿瘤	16	8	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 TTD DN	84	63	该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进展	88	58	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增	178	108	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B	392	251	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER HIGH RECURRENCE	49	31	该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌	747	453	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEITZ NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY 8P DELETION UP	73	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA ERCC3 ALLELE XPCS VS TTD DN	36	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN	855	609	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTORIATI MDM4 TARGETS FETAL LIVER DN	514	319	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HATADA METHYLATED IN LUNG CANCER UP	390	236	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK	1652	1023	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK	1442	892	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KHETCHOUMIAN TRIM24 TARGETS UP	47	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIAO METASTASIS	539	324	该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼衰老	77	60	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌7Q21 Q22 AMPLICON	76	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 UP	256	159	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 SIGNALING VIA CTNNB1	83	58	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD BMYB MORPHOLINO DN	200	112	该途径中的所有SZGR 2.0基因
POMEROY MEDULLOBLASTOMA DESMOPLASIC VS CLASSIC DN	59	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc E2F1 UP	56	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO HYPOXIA UP	207	145	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP	555	346	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB TARGETS	318	215	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴与血液DN	162	102	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP	182	119	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGLESIAS E2F TARGETS UP	151	103	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN MULTIPLE MYELOMA DN	41	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时DN	86	62	该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿Vegfa目标6HR	59	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德斯癌元签名	64	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Gist vs滑膜肉瘤	19	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIBA RESPONSE TO TSA UP	52	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿·维加法（Weston Vegfa）目标12小时	35	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时DN	101	70	该途径中的所有SZGR 2.0基因
布莱洛克ALZHEIMERS DISEASE UP	1691年	1088	该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿Vegfa目标	108	71	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C2的反应	25	18	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHODES UNDIFFERENTIATED CANCER	69	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING MUSCLE DN	46	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1的早期反应	58	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时DN	91	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液	222	139	该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏	487	303	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN	128	93	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEEN RESPONSE TO ROSIGLITAZONE DN	106	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlingemann皮肤致癌TPA DN	29	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramaswamy转移	66	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
kayo卡路里限制肌肉	95	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标DN	120	69	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOUGLAS BMI1 TARGETS DN	314	188	该途径中的所有SZGR 2.0基因
转移DN期间的clasper淋巴管	36	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE UP	578	341	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZKI TUMOR INVASIVENESS 3D UP	210	124	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌	973	570	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER CANCER WITH H3K27ME3 UP	295	149	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL UP	260	174	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Thum mir21靶向心脏病	17	7	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROMER TUMORIGENESIS UP	63	36	该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性	374	247	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUIZ TNC TARGETS UP	153	107	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN	435	289	该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络	1210	725	该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn	668	419	该途径中的所有SZGR 2.0基因
cro骨基质刺激	60	42	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROONQUIST NRAS VS STROMAL STIMULATION DN	99	65	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS CTNNB1 DN	170	105	该途径中的所有SZGR 2.0基因
woo肝癌复发	105	75	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S1	237	159	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG REGULATED BY MYC DN	253	192	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN ES ICP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3	137	85	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 16	79	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤间充质	216	130	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合	567	365	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG AR目标DN	19	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS UP	504	321	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE LATE	1137	655	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS DN	229	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM GLIS2 TARGETS UP	84	61	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN	315	215	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILANGES SERUM SENSITIVE VIA TSC2	39	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向	682	433	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ANASTASSIOU CANCER MESENCHYMAL TRANSITION SIGNATURE	64	40	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上	297	194	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA胶原蛋白	44	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质	275	148	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵	1028	559	该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌簇4	19	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：COL1A2