基因页:WDR64
概括?
基因 | 128025 |
象征 | WDR64 |
同义词 | - |
描述 | WD重复域64 |
参考 | HGNC:HGNC:26570|ENSEMBL:ENSG00000162843|HPRD:13412| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q43 |
胎儿β | 0.109 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 皮质 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
WDR64 | CHR1 | 241850816 | C | t | NM_144625 | p.288a> v | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS149319 | CHR5 | 96025248 | WDR64 | 128025 | 0.17 | 反式 | ||
RS6429292 | 1 | 241850498 | WDR64 | ENSG00000162843.13 | 1.18592E-6 | 0.03 | 34918 | gtex_brain_ba24 |
RS12133073 | 1 | 241851745 | WDR64 | ENSG00000162843.13 | 8.27615E-7 | 0.03 | 36165 | gtex_brain_ba24 |
RS60280115 | 1 | 241852608 | WDR64 | ENSG00000162843.13 | 1.61028E-6 | 0.03 | 37028 | gtex_brain_ba24 |
RS7543214 | 1 | 241853330 | WDR64 | ENSG00000162843.13 | 8.631E-7 | 0.03 | 37750 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |