基因页面:ARHGEF19
总结吗?
| GeneID | 128272年 |
| 象征 | ARHGEF19 |
| 同义词 | WGEF |
| 描述 | ρ鸟嘌呤核苷酸交换因子19 |
| 参考 | MIM: 612496|HGNC: HGNC: 26604|运用:ENSG00000142632|HPRD: 10659|织女:OTTHUMG00000002219 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p36.13 |
| 帕斯卡假定值 | 0.047 |
| eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs221035 | 1 | 16526529 | ARHGEF19 | ENSG00000142632.12 | 1.49994 e-8 | 0 | 12575年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs200243292 | 1 | 16528472 | ARHGEF19 | ENSG00000142632.12 | 2.13619 e-9 | 0 | 10632年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs221045 | 1 | 16530049 | ARHGEF19 | ENSG00000142632.12 | 9.28062 e-9 | 0 | 9055年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs221052 | 1 | 16533022 | ARHGEF19 | ENSG00000142632.12 | 8.85589 e-9 | 0 | 6082年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs71574166 | 1 | 16533830 | ARHGEF19 | ENSG00000142632.12 | 1.56673 e-8 | 0 | 5274年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs221061 | 1 | 16535804 | ARHGEF19 | ENSG00000142632.12 | 3.41965 e-8 | 0 | 3300年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs221063 | 1 | 16537289 | ARHGEF19 | ENSG00000142632.12 | 3.42836 e-8 | 0 | 1815年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3030196 | 1 | 16537781 | ARHGEF19 | ENSG00000142632.12 | 6.85314 e-8 | 0 | 1323年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| BIOCARTA肌凝蛋白通路 | 31日 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA PAR1通路 | 37 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3连结控制协定 | 142年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 德拉克洛瓦RARG绑定MEF | 367年 | 231年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |