基因页:TBC1D20
概括?
基因 | 128637 |
象征 | TBC1D20 |
同义词 | C20ORF140 | WARBM4 |
描述 | TBC1域家庭成员20 |
参考 | MIM:611663|HGNC:HGNC:16133|Ensembl:ENSG00000125875|HPRD:15472|Vega:Otthumg0000000031637 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20p13 |
Pascal P值 | 0.714 |
Sherlock P值 | 0.49 |
胎儿β | 0.025 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00076353 | 20 | 442752 | TBC1D20 | 1.994E-4 | -0.409 | 0.035 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | TBC1D20 | 128637 | 0.13 | 反式 | ||
RS7787830 | CHR7 | 98797019 | TBC1D20 | 128637 | 0.13 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | TBC1D20 | 128637 | 4.402E-5 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TBC1D20_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) | 98 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |