基因页面:SGSM1
总结吗?
GeneID | 129049年 |
象征 | SGSM1 |
同义词 | RUTBC2 |
描述 | 小G蛋白信号调制器1 |
参考 | MIM: 611417|HGNC: HGNC: 29410|运用:ENSG00000167037|织女:OTTHUMG00000150837 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 22 q11.23 |
帕斯卡假定值 | 0.04 |
eGene | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.031 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs695809 | chr22 | 26278127 | SGSM1 | 129049年 | 0.06 | 独联体 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SGSM1_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005097 | Rab GTPase激活活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0032313 | Rab GTPase监管活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005794 | 高尔基体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
伊万诺娃造血干细胞 | 254年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗5 | 482年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
麦凯布受HOXC6 | 469年 | 239年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过C组TP53棕熊短波紫外线反应 | 92年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-9 | 216年 | 223年 | 1、m8 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |