基因页：XIRP2
概括？
| 基因 | 129446 |
| 象征 | XIRP2 |
| 同义词 | CMYA3 |
| 描述 | XIN肌动蛋白结合重复包含2 |
| 参考 | MIM：609778|HGNC：HGNC：14303|Ensembl：ENSG00000163092|HPRD：10267|Vega：Otthumg00000154027 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q24.3 |
| Pascal P值 | 0.186 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02395 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| XIRP2 | CHR2 | 168067324 | C | 一个 | NM_001079810 NM_001199143 NM_001199144 NM_001199145 NM_152381 |
p.214h> q p.247h> q 。 。 p.214h> q |
错过 错过 5-UTR 5-UTR 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG12769138 | 2 | 168150203 | XIRP2 | 7.26e-8 | -0.012 | 1.74E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003779 | 肌动蛋白结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Li Cisplatin抗性DN | 35 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼头颈癌F | 54 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由SALL4同工型绑定的RAO A | 182 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |