基因页：Col8a1
概括？
| 基因 | 1295 |
| 象征 | Col8a1 |
| 同义词 | C3orf7 |
| 描述 | 胶原型VIII Alpha 1 |
| 参考 | MIM：120251|HGNC：HGNC：2215|ENSEMBL：ENSG00000144810|HPRD：00372| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q12.3 |
| Pascal P值 | 0.048 |
| 胎儿β | -0.405 |
| 主持人 | 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.04047 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.04359 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10994209 | Chr10 | 61877705 | Col8a1 | 1295 | 0.01 | 反式 | ||
| RS6440606 | 3 | 99153006 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 3.573E-6 | 0.01 | -204313 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4402963 | 3 | 99153543 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 5.752E-6 | 0.01 | -203776 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4532167 | 3 | 99156492 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 3.075E-6 | 0.01 | -200827 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2880364 | 3 | 99156869 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 1.426E-6 | 0.01 | -200450 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700666 | 3 | 99157048 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.877E-6 | 0.01 | -200271 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2464149 | 3 | 99157687 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.687E-6 | 0.01 | -199632 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700656 | 3 | 99157832 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.687E-6 | 0.01 | -199487 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700650 | 3 | 99158618 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -198701 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700645 | 3 | 99159460 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -197859 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700633 | 3 | 99160551 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -196768 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700632 | 3 | 99160577 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -196742 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670331 | 3 | 99160633 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.744e-6 | 0.01 | -196686 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670332 | 3 | 99160639 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -196680 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670335 | 3 | 99161297 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -196022 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2458516 | 3 | 99161582 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -195737 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670338 | 3 | 99162536 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -194783 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670340 | 3 | 99162713 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -194606 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670342 | 3 | 99163190 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.67E-6 | 0.01 | -194129 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670343 | 3 | 99163341 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 3.101E-6 | 0.01 | -193978 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670344 | 3 | 99163610 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 6.645e-6 | 0.01 | -193709 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700617 | 3 | 99163611 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 6.618E-6 | 0.01 | -193708 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670345 | 3 | 99163774 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -193545 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670346 | 3 | 99163961 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -193358 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2262623 | 3 | 99164806 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -192513 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2464147 | 3 | 99165484 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -191835 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2951498 | 3 | 99166060 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -191259 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2951497 | 3 | 99166634 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -190685 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670321 | 3 | 99167107 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -190212 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670322 | 3 | 99167401 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.6e-6 | 0.01 | -189918 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700652 | 3 | 99168238 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.678E-6 | 0.01 | -189081 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670323 | 3 | 99168893 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.678E-6 | 0.01 | -188426 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670325 | 3 | 99169461 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 3.483E-6 | 0.01 | -187858 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2942828 | 3 | 99169691 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -187628 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670326 | 3 | 99169854 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.464e-6 | 0.01 | -187465 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700653 | 3 | 99169966 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -187353 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700654 | 3 | 99169981 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -187338 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700655 | 3 | 99170697 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 5.168e-6 | 0.01 | -186622 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2458515 | 3 | 99171844 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 3.216E-6 | 0.01 | -185475 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7614897 | 3 | 99173177 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 4.084e-6 | 0.01 | -184142 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7427502 | 3 | 99174171 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.564E-6 | 0.01 | -183148 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700662 | 3 | 99175428 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.678E-6 | 0.01 | -181891 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS34745711 | 3 | 99177642 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.678E-6 | 0.01 | -179677 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670330 | 3 | 99178087 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.682E-6 | 0.01 | -179232 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2700657 | 3 | 99178245 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.58e-6 | 0.01 | -179074 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2246151 | 3 | 99179308 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.678E-6 | 0.01 | -178011 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2246020 | 3 | 99180244 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 7.601E-7 | 0.01 | -177075 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2670329 | 3 | 99182357 | Col8a1 | ENSG00000144810.11 | 2.587E-6 | 0.01 | -174962 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005198 | 结构分子活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | IEA | - | |
| GO：0050673 | 上皮细胞增殖 | IEA | - | |
| GO：0048593 | 摄像机型眼形形态发生 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005591 | 胶原型VIII | 塔斯 | 2029894 | |
| 去：0005604 | 地下膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID AVB3整合素途径 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Syndecan 1途径 | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞外基质组织 | 87 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胶原蛋白形成 | 58 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bertucci髓质与导管乳腺癌DN | 169 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| turashvili乳房小叶癌与导管正常 | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN | 74 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌先进与早期 | 175 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wamunyokoli卵巢癌LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌DN | 77 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Baris甲状腺癌DN | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房3 4WK | 214 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal TGFB1靶向 | 169 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 8p缺失DN的Seitz肿瘤转化 | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发12小时DN | 57 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 康（Kang）因tert而永生 | 89 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Petrova内皮淋巴与血液DN | 162 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染24小时DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Maclachlan BRCA1靶向DN | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Simbulan Parp1靶向 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia延迟对TGFB1的响应 | 39 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung可卡因奖励4WK | 75 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Burton脂肪形成峰在0hr | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lein脉络丛标记 | 103 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yague pryumor耐药性DN | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS HCP与H3未甲基化 | 80 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nakayama FGF2目标 | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村掺杂早期 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia对TGFB1 C6的反应 | 5 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn | 88 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Naba胶原蛋白 | 44 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-493-5p | 143 | 149 | 1a | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |