概括
基因 129831
象征 RBM45
同义词 drb1 | rb-1
描述 RNA结合基序蛋白45
参考 MIM:608888|HGNC:HGNC:24468|Ensembl:ENSG00000155636|HPRD:09927|Vega:Otthumg00000154202
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q31.2
Pascal P值 0.067
Sherlock P值 0.644
胎儿β 0.264
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16894557 CHR6 28999825 RBM45 129831 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003676 核酸结合 IEA -
去:0003723 RNA结合 艾达 12220514
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007399 神经系统的发展 ISS 神经突(GO期限:5) -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
去:0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 艾达 12220514
去:0005737 细胞质 艾达 12220514

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
GHO ATF5靶向 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1靶向 93 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-30-3p 47 54 1A,M8 HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-320 87 93 M8 HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-375 8 14 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga
mir-544 238 244 1a HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu