概括
基因 1301
象征 Col11a1
同义词 co11a1 | coll6 | stl2
描述 胶原型XI Alpha 1
参考 MIM:120280|HGNC:HGNC:2186|Ensembl:ENSG00000060718|HPRD:00375|Vega:Otthumg0000000010872
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p21
Pascal P值 0.022
Sherlock P值 0.626
胎儿β -0.533

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ppm1l 0.75 0.64
A2BP1 0.74 0.71
RGS6 0.74 0.74
clstn2 0.74 0.73
DOCK4 0.73 0.72
clcn4 0.73 0.67
刺。2 0.72 0.70
NRCAM 0.72 0.73
hecw2 0.72 0.74
KCNK9 0.72 0.61
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Rhoc -0.54 -0.61
DBI -0.48 -0.56
EFEMP2 -0.47 -0.51
serpinb6 -0.46 -0.40
VEGFB -0.45 -0.49
Rab34 -0.45 -0.49
PSME2 -0.45 -0.46
C19orf36 -0.44 -0.45
slc2a4rg -0.43 -0.40
AL139819.3 -0.42 -0.48

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg焦点粘附 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ECM受体相互作用 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Integin1途径 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3整合素途径 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Syndecan 1途径 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞外基质组织 87 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胶原蛋白形成 58 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合DN的Davicioni目标DN 68 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni Rhabdomyosarcoma PAX FOXO1融合DN 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与导管正常 44 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与小叶正常 73 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与导管正常 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN 74 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wilcox对孕酮DN的反应 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Corre多发性骨髓瘤DN 62 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纽曼ERCC6靶向DN 39 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌先进与早期 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向DN 260 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向DN 133 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化Kras DN 142 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN 153 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶标为B 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP DN 35 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Cisplatin抗性 28 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
co牛MYCN目标 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
锯齿状斑瘤肿瘤发生RET C634R 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌B 48 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿比·lif信号2向上 14 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delaserna Myod目标DN 57 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Burton脂肪形成峰在0hr 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杰克逊DNMT1靶向DN 25 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G1 67 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng IL22信号传导DN 42 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mirlet7a3 DN的Brueckner目标 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer肿瘤发生 63 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
池子侵入性乳腺癌 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
woo肝癌复发 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA2 UP 87 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村脂肪形成晚期 104 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
anastassiou癌症间充质过渡特征 64 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Naba胶原蛋白 44 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因