基因页:Col11a1
概括?
基因 | 1301 |
象征 | Col11a1 |
同义词 | co11a1 | coll6 | stl2 |
描述 | 胶原型XI Alpha 1 |
参考 | MIM:120280|HGNC:HGNC:2186|Ensembl:ENSG00000060718|HPRD:00375|Vega:Otthumg0000000010872 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p21 |
Pascal P值 | 0.022 |
Sherlock P值 | 0.626 |
胎儿β | -0.533 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/COL11A1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ppm1l | 0.75 | 0.64 |
A2BP1 | 0.74 | 0.71 |
RGS6 | 0.74 | 0.74 |
clstn2 | 0.74 | 0.73 |
DOCK4 | 0.73 | 0.72 |
clcn4 | 0.73 | 0.67 |
刺。2 | 0.72 | 0.70 |
NRCAM | 0.72 | 0.73 |
hecw2 | 0.72 | 0.74 |
KCNK9 | 0.72 | 0.61 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Rhoc | -0.54 | -0.61 |
DBI | -0.48 | -0.56 |
EFEMP2 | -0.47 | -0.51 |
serpinb6 | -0.46 | -0.40 |
VEGFB | -0.45 | -0.49 |
Rab34 | -0.45 | -0.49 |
PSME2 | -0.45 | -0.46 |
C19orf36 | -0.44 | -0.45 |
slc2a4rg | -0.43 | -0.40 |
AL139819.3 | -0.42 | -0.48 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG ECM受体相互作用 | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Integin1途径 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AVB3整合素途径 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Syndecan 1途径 | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞外基质组织 | 87 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胶原蛋白形成 | 58 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX FOXO1融合DN的Davicioni目标DN | 68 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni Rhabdomyosarcoma PAX FOXO1融合DN | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房导管癌与导管正常 | 44 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房导管癌与小叶正常 | 73 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房小叶癌与导管正常 | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN | 74 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wilcox对孕酮DN的反应 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Corre多发性骨髓瘤DN | 62 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纽曼ERCC6靶向DN | 39 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌先进与早期 | 175 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向DN | 260 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC2靶向DN | 133 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化Kras DN | 142 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN | 153 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶标为B | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP DN | 35 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LI在肺癌中扩增 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Cisplatin抗性 | 28 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
co牛MYCN目标 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
锯齿状斑瘤肿瘤发生RET C634R | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌B | 48 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert) | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿比·lif信号2向上 | 14 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML Fab标记 | 191 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delaserna Myod目标DN | 57 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对紫外线nhek的反应 | 244 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Burton脂肪形成峰在0hr | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杰克逊DNMT1靶向DN | 25 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G1 | 67 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng IL22信号传导DN | 42 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mirlet7a3 DN的Brueckner目标 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer肿瘤发生 | 63 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
woo肝癌复发 | 105 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA2 UP | 87 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村脂肪形成晚期 | 104 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
anastassiou癌症间充质过渡特征 | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Naba胶原蛋白 | 44 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |