基因页：Col11a2
概括？
| 基因 | 1302 |
| 象征 | Col11a2 |
| 同义词 | dfna13 | dfnb53 | fbcg2 | hke5 | parp | stl3 |
| 描述 | 胶原型XI Alpha 2 |
| 参考 | MIM：120290|HGNC：HGNC：2187|Ensembl：ENSG00000204248|HPRD：00376|HPRD：09049|Vega：Otthumg00000031036 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.3 |
| Pascal P值 | 1.381E-4 |
| 胎儿β | -0.451 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG16627086 | 6 | 33143807 | Col11a2 | 5.82e-5 | 0.315 | 0.023 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0030020 | 细胞外基质结构组成赋予拉伸强度 | nas | 7859284|8838804 | |
| 去：0005198 | 结构分子活性 | IEA | - | |
| 去：0005201 | 细胞外基质结构成分 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001501 | 骨骼系统开发 | nas | 7859284|8838804 | |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | IEA | - | |
| 去：0007605 | 声音的感官感知 | IEA | - | |
| 去：0030199 | 胶原纤维组织 | nas | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005581 | 胶原 | IEA | - | |
| 去：0005592 | 胶原型XI | nas | 7859284|8838804 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG ECM受体相互作用 | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Integin1途径 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID AVB3整合素途径 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Syndecan 1途径 | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞外基质组织 | 87 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胶原蛋白形成 | 58 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘普通癌基因 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 | 92 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramalho茎DN | 74 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amundson Gamma辐射阻力 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 | 74 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巨噬细胞的库马尔病原体负荷 | 275 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Naba胶原蛋白 | 44 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-23 | 965 | 971 | M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
| HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
| mir-24 | 814 | 821 | 1A，M8 | HSA-MIR-24SZ | uggcucucagagcaggaagag |
| mir-323 | 964 | 971 | 1A，M8 | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |