概括
基因 130340
象征 AP1S3
同义词 诗篇15
描述 适配器相关的蛋白质复合物1 Sigma 3亚基
参考 MIM:615781|HGNC:HGNC:18971|HPRD:16495|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q36.1
Pascal P值 0.859
Sherlock P值 0.747
胎儿β 0.138

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01016
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00916
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0008565 蛋白质转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006897 内吞作用 IEA -
去:0006886 细胞内蛋白转运 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005829 细胞质 经验 15569716
去:0030117 膜外套 IEA -
去:0016020 IEA -
去:0005905 涂层坑 IEA -
去:0030130 跨加利基网络囊泡的网格蛋白涂层 IEA -
GO:0031410 细胞质囊泡 IEA -
去:0030659 细胞质囊泡膜 IEA -
去:0030131 网格蛋白适配器复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg溶酶体 121 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sabates结直肠腺瘤 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
co牛MYCN目标 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D 139 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanloo SP3靶向DN 89 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TERAO AOX4靶向HG 28 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Madan DPPA4目标 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的611CTF同工型的PEDERSEN目标 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-186 3283 3289 1a HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-188 112 118 M8 HSA-MIR-188 cucccuugcaugguggggu
mir-204/211 111 117 M8 HSA-MIR-204 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
mir-496 376 382 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc