基因页面:ALS2CR12
总结吗?
| GeneID | 130540年 |
| 象征 | ALS2CR12 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 肌萎缩性脊髓侧索硬化症2染色体区域候选人12 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 14439|运用:ENSG00000155749|HPRD: 12444|织女:OTTHUMG00000132824 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 q33.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.074 |
| 胎儿β | -0.699 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs55971105 | 2 | 202123717 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 2.471 e - | 0 | 98404年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6735656 | 2 | 202124502 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 3.576 e-6 | 0 | 97619年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10931936 | 2 | 202143928 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.309 e-6 | 0 | 78193年 | gtex_brain_ba24 |
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| rs3185378 | 2 | 202151439 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.966 e-8 | 0 | 70682年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1035142 | 2 | 202153078 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.966 e-8 | 0 | 69043年 | gtex_brain_ba24 |
| rs700635 | 2 | 202153225 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.309 e-6 | 0 | 68896年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6714430 | 2 | 202153684 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.309 e-6 | 0 | 68437年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6743068 | 2 | 202153920 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.309 e-6 | 0 | 68201年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7587417 | 2 | 202156054 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.53 e - | 0 | 66067年 | gtex_brain_ba24 |
| rs13029511 | 2 | 202161033 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.169 e-8 | 0 | 61088年 | gtex_brain_ba24 |
| rs13016963 | 2 | 202162811 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 3.32 e-8 | 0 | 59310年 | gtex_brain_ba24 |
| rs9288316 | 2 | 202163483 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.964 e-8 | 0 | 58638年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7560328 | 2 | 202164837 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 2.476 e-8 | 0 | 57284年 | gtex_brain_ba24 |
| rs113962644 | 2 | 202167651 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.956 e-8 | 0 | 54470年 | gtex_brain_ba24 |
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| rs6731171 | 2 | 202179011 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 6.759 e - | 0 | 43110年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6735641 | 2 | 202180491 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.846 e-8 | 0 | 41630年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1830298 | 2 | 202181247 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.928 e-6 | 0 | 40874年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10804112 | 2 | 202184165 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.741 e-8 | 0 | 37956年 | gtex_brain_ba24 |
| rs9677180 | 2 | 202184331 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.346 e-6 | 0 | 37790年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2080304 | 2 | 202186422 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 2.732 e-8 | 0 | 35699年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2349073 | 2 | 202186986 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.305 e-6 | 0 | 35135年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10197246 | 2 | 202204741 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 3.629 e-6 | 0 | 17380年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10931933 | 2 | 202112471 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 4.244 e - | 0 | 109650年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12990906 | 2 | 202114624 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 2.52 e-6 | 0 | 107497年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs7585508 | 2 | 202118753 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 2.52 e-6 | 0 | 103368年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10931934 | 2 | 202119789 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 2.52 e-6 | 0 | 102332年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs3769821 | 2 | 202123430 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 4.296 e-9 | 0 | 98691年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs59308963 | 2 | 202123479 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 8.515 e-8 | 0 | 98642年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs55971105 | 2 | 202123717 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 3.995 e-11 | 0 | 98404年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs7587417 | 2 | 202156054 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.967 e-12 | 0 | 66067年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs13029511 | 2 | 202161033 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 4.382 e-11 | 0 | 61088年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs7560328 | 2 | 202164837 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 7.605 e-14 | 0 | 57284年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2080303 | 2 | 202165206 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.287 e-8 | 0 | 56915年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113962644 | 2 | 202167651 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 4.793 e-14 | 0 | 54470年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6712091 | 2 | 202169132 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 4.962平台以及 | 0 | 52989年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10200279 | 2 | 202170655 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 5.417 e-8 | 0 | 51466年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs7582362 | 2 | 202176294 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 5.04 e-8 | 0 | 45827年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6731171 | 2 | 202179011 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 2.786 e-11 | 0 | 43110年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6735641 | 2 | 202180491 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 5.294 e-14 | 0 | 41630年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1830298 | 2 | 202181247 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 2.165 e-8 | 0 | 40874年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10804112 | 2 | 202184165 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 5.476 e-14 | 0 | 37956年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9677180 | 2 | 202184331 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 4.341 e-8 | 0 | 37790年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2110690 | 2 | 202185132 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 3.623 e - | 0 | 36989年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2080304 | 2 | 202186422 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 1.098 e-11 | 0 | 35699年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2349073 | 2 | 202186986 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 3.419 e-8 | 0 | 35135年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10197246 | 2 | 202204741 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 3.606 e-8 | 0 | 17380年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs13036109 | 2 | 202235943 | ALS2CR12 | ENSG00000155749.8 | 4.385 e-6 | 0 | -13822年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 | 280年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |