概括
基因 1308
象征 Col17a1
同义词 BA16H23.2 | BP180 | BPA-2 | BPAG2 | ERED | LAD-1
描述 胶原型XVII Alpha 1
参考 MIM:113811|HGNC:HGNC:2194|Ensembl:ENSG0000000065618|HPRD:00223|Vega:Otthumg0000000018998
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q24.3
Pascal P值 0.059
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
hiatl1 0.74 0.72
DAZAP2 0.73 0.72
Rab5b 0.73 0.71
Stat5b 0.73 0.73
Stat3 0.72 0.71
ADAM9 0.71 0.72
SYT11 0.71 0.70
tor1aip1 0.70 0.75
SNX1 0.70 0.70
MPP5 0.70 0.74
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RP9P -0.41 -0.41
FAM159B -0.41 -0.42
AL022328.1 -0.38 -0.29
AC135724.1 -0.37 -0.35
AF347015.21 -0.37 -0.19
AC010300.1 -0.36 -0.31
AC087071.1 -0.35 -0.29
AC098691.2 -0.34 -0.18
AC005921.3 -0.34 -0.31
ACSM3 -0.33 -0.30

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID AVB3整合素途径 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Syndecan 1途径 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID A6B1 A6B4整合素途径 46 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞通信 120 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞外基质组织 87 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胶原蛋白形成 58 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞连接组织 78 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放射疗法反应性DN 92 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与导管正常DN 198 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
瓦特自动甲状腺腺瘤 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移DN 81 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C8的反应 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化小脑DN 86 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRAS和STK11的JI致癌作用 12 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kyng环境应力响应不是WS中的4NQO 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng环境应力反应DN 21 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村转移模型 45 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Naba胶原蛋白 44 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因