基因页:Col17a1
概括?
基因 | 1308 |
象征 | Col17a1 |
同义词 | BA16H23.2 | BP180 | BPA-2 | BPAG2 | ERED | LAD-1 |
描述 | 胶原型XVII Alpha 1 |
参考 | MIM:113811|HGNC:HGNC:2194|Ensembl:ENSG0000000065618|HPRD:00223|Vega:Otthumg0000000018998 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q24.3 |
Pascal P值 | 0.059 |
主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/COL17A1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
hiatl1 | 0.74 | 0.72 |
DAZAP2 | 0.73 | 0.72 |
Rab5b | 0.73 | 0.71 |
Stat5b | 0.73 | 0.73 |
Stat3 | 0.72 | 0.71 |
ADAM9 | 0.71 | 0.72 |
SYT11 | 0.71 | 0.70 |
tor1aip1 | 0.70 | 0.75 |
SNX1 | 0.70 | 0.70 |
MPP5 | 0.70 | 0.74 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RP9P | -0.41 | -0.41 |
FAM159B | -0.41 | -0.42 |
AL022328.1 | -0.38 | -0.29 |
AC135724.1 | -0.37 | -0.35 |
AF347015.21 | -0.37 | -0.19 |
AC010300.1 | -0.36 | -0.31 |
AC087071.1 | -0.35 | -0.29 |
AC098691.2 | -0.34 | -0.18 |
AC005921.3 | -0.34 | -0.31 |
ACSM3 | -0.33 | -0.30 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID AVB3整合素途径 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Syndecan 1途径 | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID A6B1 A6B4整合素途径 | 46 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞通信 | 120 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞外基质组织 | 87 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胶原蛋白形成 | 58 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞连接组织 | 78 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
渡边直肠癌放射疗法反应性DN | 92 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房导管癌与导管正常DN | 198 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
瓦特自动甲状腺腺瘤 | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer转移DN | 81 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee老化小脑DN | 86 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KRAS和STK11的JI致癌作用 | 12 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kyng环境应力响应不是WS中的4NQO | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng环境应力反应DN | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村转移模型 | 45 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Naba胶原蛋白 | 44 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |