基因页：CPNE4
概括？
| 基因 | 131034 |
| 象征 | CPNE4 |
| 同义词 | COPN4 | CPN4 |
| 描述 | 美洲4 |
| 参考 | MIM：604208|HGNC：HGNC：2317|ENSEMBL：ENSG00000196353|HPRD：05017| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q22.1 |
| Pascal P值 | 0.019 |
| Sherlock P值 | 0.97 |
| 胎儿β | -2.183 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 结构可塑性 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG18512963 | 3 | 131430364 | CPNE4 | 4.565E-4 | -0.453 | 0.046 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10969802 | Chr9 | 30636427 | CPNE4 | 131034 | 0.09 | 反式 | ||
| RS10969816 | Chr9 | 30661611 | CPNE4 | 131034 | 0.09 | 反式 | ||
| RS12350524 | Chr9 | 30743421 | CPNE4 | 131034 | 0.09 | 反式 | ||
| RS12343068 | Chr9 | 30783524 | CPNE4 | 131034 | 0.09 | 反式 | ||
| RS10511868 | Chr9 | 30816504 | CPNE4 | 131034 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 动作 | PS1TP5BP1 | Actin，Beta | - | HPRD | 12522145 |
| Bcor | anop2 |FLJ20285 |FLJ38041 |KIAA1575 |maa2 |MCOPS2 |MGC131961 |MGC71031 | Bcl6共抑制剂 | - | HPRD | 12522145 |
| CCDC22 | CXORF37 |JM1 | 包含22 | - | HPRD | 12522145 |
| CPNE1 | COPN1 |CPN1 |MGC1142 | 美洲i | - | HPRD | 12522145 |
| MAP2K1 | mapkk1 |MEK1 |MKK1 |prkmk1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶1 | - | HPRD | 12522145 |
| mycbp | amy-1 | C-MYC结合蛋白 | - | HPRD | 12522145 |
| PDCD6 | ALG-2 |FLJ46208 |MGC111017 |MGC119050 |MGC9123 |PEF1B | 程序性细胞死亡6 | - | HPRD | 12522145 |
| PITPNM2 | KIAA1457 |NIR3 |RDGB2 |rdgba2 | 磷脂酰肌醇转移蛋白，膜相关2 | - | HPRD | 12522145 |
| PPP5C | FLJ36922 |pp5 |PPP5 | 蛋白质磷酸酶5，催化亚基 | - | HPRD | 12522145 |
| RDX | DFNB24 | radixin | - | HPRD | 12522145 |
| 冰鞋 | sno |snoa |SNON | 滑雪型癌基因 | - | HPRD | 12522145 |
| SPTBN1 | 精灵|SPTB2 |Betaspii | 光谱，β，非肉毒杆菌1 | - | HPRD | 12522145 |
| UBE2M | UBC-RS2 |UBC12 |HUBC12 | 泛素结合酶E2M（UBC12同源物，酵母） | - | HPRD | 12522145 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fujii YBX1靶向 | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |