基因页：CCDC58
概括？
| 基因 | 131076 |
| 象征 | CCDC58 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 包含58 |
| 参考 | HGNC：HGNC：31136|ENSEMBL：ENSG00000160124|HPRD：18548|Vega：Otthumg00000159490 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q21.1 |
| Pascal P值 | 0.416 |
| 胎儿β | -0.018 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG13713052 | 3 | 122102218 | CCDC58 | 3.43e-8 | -0.02 | 1.02E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG16532529 | 3 | 122101951 | CCDC58 | 4.26E-8 | -0.02 | 1.18e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11716910 | CHR3 | 121987618 | CCDC58 | 131076 | 1.8e-5 | 顺式 | ||
| RS3792288 | CHR3 | 121993431 | CCDC58 | 131076 | 0.19 | 顺式 | ||
| RS4678174 | CHR3 | 122000870 | CCDC58 | 131076 | 0 | 顺式 | ||
| RS10934581 | CHR3 | 122011153 | CCDC58 | 131076 | 2.369E-6 | 顺式 | ||
| RS7633800 | CHR3 | 122011664 | CCDC58 | 131076 | 9.319E-7 | 顺式 | ||
| RS7633667 | CHR3 | 122011725 | CCDC58 | 131076 | 1.126E-6 | 顺式 | ||
| RS17252533 | CHR3 | 122022206 | CCDC58 | 131076 | 0 | 顺式 | ||
| RS7616785 | CHR3 | 122072878 | CCDC58 | 131076 | 3.242e-5 | 顺式 | ||
| RS6807375 | CHR3 | 122082274 | CCDC58 | 131076 | 1.335E-5 | 顺式 | ||
| RS12488155 | CHR3 | 122082837 | CCDC58 | 131076 | 1.169E-5 | 顺式 | ||
| RS11932 | CHR3 | 122141134 | CCDC58 | 131076 | 0.07 | 顺式 | ||
| RS6438731 | CHR3 | 122180949 | CCDC58 | 131076 | 3.849E-5 | 顺式 | ||
| RS10934602 | CHR3 | 122223181 | CCDC58 | 131076 | 0.04 | 顺式 | ||
| RS6438737 | CHR3 | 122228973 | CCDC58 | 131076 | 0.05 | 顺式 | ||
| RS4485669 | CHR3 | 122234614 | CCDC58 | 131076 | 3.419E-5 | 顺式 | ||
| RS6810306 | CHR3 | 122248709 | CCDC58 | 131076 | 7.661E-5 | 顺式 | ||
| RS11716910 | CHR3 | 121987618 | CCDC58 | 131076 | 0 | 反式 | ||
| RS4678174 | CHR3 | 122000870 | CCDC58 | 131076 | 0.11 | 反式 | ||
| RS10934581 | CHR3 | 122011153 | CCDC58 | 131076 | 4.092E-4 | 反式 | ||
| RS7633800 | CHR3 | 122011664 | CCDC58 | 131076 | 1.751E-4 | 反式 | ||
| RS7633667 | CHR3 | 122011725 | CCDC58 | 131076 | 2.095E-4 | 反式 | ||
| RS17252533 | CHR3 | 122022206 | CCDC58 | 131076 | 0.08 | 反式 | ||
| RS7616785 | CHR3 | 122072878 | CCDC58 | 131076 | 0 | 反式 | ||
| RS6807375 | CHR3 | 122082274 | CCDC58 | 131076 | 0 | 反式 | ||
| RS12488155 | CHR3 | 122082837 | CCDC58 | 131076 | 0 | 反式 | ||
| RS6438731 | CHR3 | 122180949 | CCDC58 | 131076 | 0 | 反式 | ||
| RS4485669 | CHR3 | 122234614 | CCDC58 | 131076 | 0 | 反式 | ||
| RS6810306 | CHR3 | 122248709 | CCDC58 | 131076 | 0.01 | 反式 | ||
| RS1604454 | CHR5 | 23945802 | CCDC58 | 131076 | 0.03 | 反式 | ||
| RS6863680 | CHR5 | 23996889 | CCDC58 | 131076 | 0.02 | 反式 | ||
| RS10942018 | CHR5 | 23997153 | CCDC58 | 131076 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向神经上皮 | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Varela ZMPSTE24靶向DN | 38 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |