基因页：KCNH8
概括？
| 基因 | 131096 |
| 象征 | KCNH8 |
| 同义词 | 麋鹿| elk1 | kv12.1 | elk3 |
| 描述 | 钾电源门控通道亚家族成员8 |
| 参考 | MIM：608260|HGNC：HGNC：18864|ENSEMBL：ENSG00000183960|HPRD：10006|Vega：Otthumg00000129891 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3P24.3 |
| Pascal P值 | 0.705 |
| Sherlock P值 | 0.945 |
| 胎儿β | 0.109 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 3 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 3 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.006 | |
| 表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值：1.804 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG18500192 | 3 | 19189930 | KCNH8 | 1.169E-4 | -0.329 | 0.029 | DMG：Wockner_2014 |
| CG24997944 | 3 | 19189709 | KCNH8 | 8.94e-8 | -0.008 | 2.05e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG07657236 | 3 | 19190202 | KCNH8 | 1.04E-7 | -0.016 | 2.29e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS651185 | CHR1 | 233871029 | KCNH8 | 131096 | 0.02 | 反式 | ||
| SNP_A-2241490 | 0 | KCNH8 | 131096 | 0.12 | 反式 | |||
| RS2322319 | CHR3 | 3637199 | KCNH8 | 131096 | 0.15 | 反式 | ||
| RS17256926 | CHR5 | 9399927 | KCNH8 | 131096 | 0.1 | 反式 | ||
| RS5003961 | CHR7 | 78072443 | KCNH8 | 131096 | 0.01 | 反式 | ||
| RS4515471 | CHR7 | 78072585 | KCNH8 | 131096 | 0.01 | 反式 | ||
| RS10259327 | CHR7 | 78074924 | KCNH8 | 131096 | 0.01 | 反式 | ||
| RS16924550 | CHR12 | 22174951 | KCNH8 | 131096 | 0.16 | 反式 | ||
| RS17137051 | CHR16 | 4521748 | KCNH8 | 131096 | 0.14 | 反式 | ||
| RS184583 | CHR19 | 30371589 | KCNH8 | 131096 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000155 | 两分量传感器活性 | IEA | - | |
| 去：0005244 | 电压门控离子通道活性 | IEA | - | |
| 去：0005249 | 电压门控钾通道活动 | IEA | - | |
| 去：0030955 | 钾离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000160 | 两组分量信号转导系统（磷层） | IEA | - | |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| 去：0006813 | 钾离子运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome电压门控钾通道 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome钾通道 | 98 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoelzel NF1靶向 | 139 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-143 | 475 | 481 | M8 | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
| mir-193 | 509 | 515 | M8 | HSA-MIR-193A | Aacuggccuacaaagucccag |
| HSA-MIR-193B | aacuggcccucaaagucccgcuuu | ||||
| mir-219 | 485 | 492 | 1A，M8 | HSA-MIR-219脑 | ugauuguccaaacgcaauucu |
| mir-221/222 | 159 | 165 | 1a | HSA-MIR-221脑 | agcuacauugucugugggggguc |
| HSA-MIR-222脑 | agcuacaucuggcuacugggucuc | ||||
| mir-485-3p | 601 | 607 | 1a | HSA-MIR-485-3P | gucauacgggcucucucucucucu |
| mir-496 | 541 | 548 | 1A，M8 | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |