概括
基因 1312
象征 COMT
同义词 HEL-S-98N
描述 儿茶酚-O-甲基转移酶
参考 MIM:116790|HGNC:HGNC:2228|Ensembl:ENSG00000093010|HPRD:00284|Vega:Otthumg00000150529
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22Q11.21
Pascal P值 0.261
Sherlock P值 0.893
胎儿β -0.214
支持 多巴胺

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 3 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:31

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15231747
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008171 O-甲基转移酶活性 IEA -
GO:0016206 儿茶酚O-甲基转移酶活性 经验 8968737
GO:0016206 儿茶酚O-甲基转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0042420 多巴胺分解代谢过程 IEA 神经递质,多巴胺(GO期限:9) -
去:0006584 儿茶酚胺代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005792 微型体 塔斯 1707278
去:0005829 细胞质 经验 8968737
去:0005625 可溶性部分 塔斯 1707278
去:0005737 细胞质 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0043231 细胞内膜结合的细胞器 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG类固醇激素生物合成 55 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg酪氨酸代谢 42 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组生物氧化 139 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome II期结合 70 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冷吉非替尼抵抗DN 230 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶标和血清反应 47 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林青春期乳腺 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang造血细胞数量小vs巨大 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark Hyppocampus 22Q11缺失DN 20 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans 185 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭葡萄糖剥夺DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weigel氧化应激反应 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老肌肉DN 123 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
coates巨噬细胞M1 vs M2向上 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因