基因页面:KLF6

总结吗?
GeneID 1316年
象征 KLF6
同义词 BCD1 | CBA1 | COPEB | CPBP | GBF | PAC1 | ST12 | ZF9
描述 Kruppel-like因子6
参考 MIM: 602053|HGNC: HGNC: 2235|运用:ENSG00000067082|HPRD: 03632|织女:OTTHUMG00000017567
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 10 p15
帕斯卡假定值 0.014
夏洛克假定值 0.72
胎儿β 1.812
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式
元

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1
协会 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 1 链接到SZGene

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg25945303 10 3827695 KLF6 3.47 e-9 -0.013 2.27 e-6 DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs6707117 chr2 136855504 KLF6 1316年 0.16 反式
snp_a - 1830437 0 KLF6 1316年 0.01 反式
rs10040715 chr5 57594207 KLF6 1316年 0.01 反式
rs2189803 chr5 137684661 KLF6 1316年 0.05 反式
rs10945911 chr6 164047509 KLF6 1316年 0.11 反式
rs10232205 chr7 23230553 KLF6 1316年 0.02 反式
rs12701006 chr7 30147298 KLF6 1316年 0.02 反式
rs4728160 chr7 128857171 KLF6 1316年 0.19 反式
rs1358128 chr8 5268072 KLF6 1316年 0.13 反式
rs16901935 chr8 128076544 KLF6 1316年 0.01 反式
rs4976941 chr8 142744439 KLF6 1316年 0.09 反式
rs9298651 chr9 10076275 KLF6 1316年 0.01 反式
rs16931013 chr9 10076859 KLF6 1316年 0.01 反式
rs16931018 chr9 10077048 KLF6 1316年 0.01 反式
rs3780642 chr9 87553144 KLF6 1316年 0.17 反式
rs3765543 chr9 134458323 KLF6 1316年 0.01 反式
rs11017433 chr10 132538234 KLF6 1316年 0.01 反式
rs17106653 chr14 78411790 KLF6 1316年 0.13 反式
rs3861624 chr14 78416193 KLF6 1316年 0.02 反式
rs7144528 chr14 78421202 KLF6 1316年 0.09 反式
rs1885073 chr14 104357181 KLF6 1316年 0 反式
rs17056922 chr18 73086804 KLF6 1316年 0.07 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
APITD1 0.99 0.97
LRRC56 0.76 0.68
CCDC106 0.73 0.77
C4orf44 0.72 0.73
CHRM4 0.71 0.79
TTC22 0.71 0.68
SLC32A1 0.70 0.73
NPY 0.69 0.71
C8orf85 0.68 0.62
风场 0.68 0.87
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
哥伦比亚广播公司 -0.34 -0.44
RNF182 -0.34 -0.49
ZEB2 -0.33 -0.31
NHSL1 -0.31 -0.44
TSPAN18 -0.31 -0.40
FAT4 -0.30 -0.29
GAB2 -0.30 -0.35
ZNF238 -0.30 -0.15
COTL1 -0.30 -0.28
LIMCH1 -0.30 -0.30

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003674 molecular_function ND - - - - - -
去:0003677 DNA结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0016563 转录激活活性 助教 9083102|9689109
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006355 依赖dna的转录调节 NAS - - - - - -
去:0006350 转录 国际能源机构 - - - - - -
去:0016049 细胞生长 NAS 9000136
去:0008150 biological_process ND - - - - - -
去:0019221 cytokine-mediated信号通路 国际能源机构 - - - - - -
去:0030183 B细胞分化 NAS 9000136
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005575 cellular_component ND - - - - - -
去:0005622 细胞内的 国际能源机构 - - - - - -
去:0005634 核 助教 9689109
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
圣ERK1 ERK2 MAPK通路 32 25 所有SZGR 2.0基因通路
PICCALUGA ANGIOIMMUNOBLASTIC淋巴瘤DN 136年 86年 所有SZGR 2.0基因通路
威尔科克斯对孕激素 152年 90年 所有SZGR 2.0基因通路
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人DN 463年 290年 所有SZGR 2.0基因通路
周炎症反应生活 485年 293年 所有SZGR 2.0基因通路
PUIFFE入侵被腹水DN 145年 91年 所有SZGR 2.0基因通路
CASORELLI急性早幼粒细胞白血病 177年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
DEURIG T细胞PROLYMPHOCYTIC白血病 368年 234年 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯DCC DN的目标 121年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
奥斯瓦尔德造血干细胞在胶原凝胶 233年 161年 所有SZGR 2.0基因通路
GARGALOVIC应对氧化磷脂绿松石 79年 50 所有SZGR 2.0基因通路
GARGALOVIC应对氧化磷脂洋红色 28 18 所有SZGR 2.0基因通路
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1 HSC融合起来 185年 126年 所有SZGR 2.0基因通路
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1融合红细胞 157年 104年 所有SZGR 2.0基因通路
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1融合持续在红细胞 44 30. 所有SZGR 2.0基因通路
ODONNELL TFRC目标了 456年 228年 所有SZGR 2.0基因通路
ODONNELL MYC和TFRC的目标 83年 50 所有SZGR 2.0基因通路
SENESE HDAC3目标了 501年 327年 所有SZGR 2.0基因通路
长岛NRG1信号了 176年 123年 所有SZGR 2.0基因通路
长岛EGF信号了 58 40 所有SZGR 2.0基因通路
维奇缺氧了 171年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
维奇DMOG缺氧的 130年 85年 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN 805年 505年 所有SZGR 2.0基因通路
HAHTOLA蕈样CD4细胞 64年 46 所有SZGR 2.0基因通路
BERENJENO岩石信号不是通过RHOA DN 48 34 所有SZGR 2.0基因通路
CONCANNON EPOXOMICIN了细胞凋亡 239年 157年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
GRAESSMANN MC和阿霉素 612年 367年 所有SZGR 2.0基因通路
GRAESSMANN MC和阿霉素DN 770年 415年 所有SZGR 2.0基因通路
约翰逊GLIOMAGENESIS PDGFB起来 58 44 所有SZGR 2.0基因通路
RIZ红细胞分化12小时 43 35 所有SZGR 2.0基因通路
EBAUER目标PAX3 FOXO1融合起来 207年 128年 所有SZGR 2.0基因通路
RASHI对电离辐射2 127年 92年 所有SZGR 2.0基因通路
DIRMEIER LMP1反应早期 66年 48 所有SZGR 2.0基因通路
王甲基化在乳腺癌 35 25 所有SZGR 2.0基因通路
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 855年 609年 所有SZGR 2.0基因通路
滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN 483年 336年 所有SZGR 2.0基因通路
DN MOHANKUMAR TLX1目标 193年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
WATTEL自治甲状腺腺瘤DN 55 29日 所有SZGR 2.0基因通路
SHETH肝癌VS TXNIP PAM1损失 229年 137年 所有SZGR 2.0基因通路
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN 584年 395年 所有SZGR 2.0基因通路
通过ELK3 DN严重缺氧 156年 106年 所有SZGR 2.0基因通路
通过ELK3和HIF1A严重缺氧 142年 104年 所有SZGR 2.0基因通路
NUYTTEN NIPP1的目标了 769年 437年 所有SZGR 2.0基因通路
NUYTTEN EZH2的目标了 1037年 673年 所有SZGR 2.0基因通路
布伊泰尔特说光动力治疗压力 811年 508年 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼肿瘤分化和管理不善的DN 382年 224年 所有SZGR 2.0基因通路
小山SEMA3B DN的目标 411年 249年 所有SZGR 2.0基因通路
阿米特延迟早期基因 18 15 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH自行车基因 648年 385年 所有SZGR 2.0基因通路
AMIT EGF响应40海拉 42 29日 所有SZGR 2.0基因通路
AMIT EGF反应60海拉 46 32 所有SZGR 2.0基因通路
AMIT 40 MCF10A EGF响应 19 11 所有SZGR 2.0基因通路
AMIT 40 MCF10A血清反应 32 21 所有SZGR 2.0基因通路
张IKK抑制剂和肿瘤坏死因子 223年 140年 所有SZGR 2.0基因通路
MORI EMU MYC淋巴瘤DN发病时间 17 9 所有SZGR 2.0基因通路
FRASOR应对雌二醇DN 82年 52 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER PBL肾移植好的VS捐赠 151年 One hundred. 所有SZGR 2.0基因通路
由氯高铁血红素ADDYA红细胞分化 73年 47 所有SZGR 2.0基因通路
松田自然杀伤细胞分化 475年 313年 所有SZGR 2.0基因通路
詹V2后期分化的基因 45 34 所有SZGR 2.0基因通路
任肺泡横纹肌肉瘤DN 408年 274年 所有SZGR 2.0基因通路
吴HBX目标2 DN 16 11 所有SZGR 2.0基因通路
DEBIASI由呼肠孤病毒感染细胞凋亡 314年 201年 所有SZGR 2.0基因通路
吴HBX目标1的DN 23 14 所有SZGR 2.0基因通路
麦克道尔急性肺损伤 45 29日 所有SZGR 2.0基因通路
DN DELASERNA MYOD目标 57 42 所有SZGR 2.0基因通路
江缺氧正常 311年 205年 所有SZGR 2.0基因通路
《图片报》极品致癌签名 261年 166年 所有SZGR 2.0基因通路
DURCHDEWALD皮肤致癌DN 264年 168年 所有SZGR 2.0基因通路
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃避DN 373年 196年 所有SZGR 2.0基因通路
郑受FOXP3 491年 310年 所有SZGR 2.0基因通路
马森受FOXP3刺激 1022年 619年 所有SZGR 2.0基因通路
马森FOXP3如果绑定 1229年 713年 所有SZGR 2.0基因通路
郑FOXP3在胸腺的目标 196年 137年 所有SZGR 2.0基因通路
桑塞姆APC MYC目标 217年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
林黑色素瘤拷贝数DN 41 34 所有SZGR 2.0基因通路
DN SARRIO上皮间充质转变 154年 101年 所有SZGR 2.0基因通路
由喀斯特IWANAGA致癌PTEN DN 353年 226年 所有SZGR 2.0基因通路
MITSIADES APLIDIN反应 439年 257年 所有SZGR 2.0基因通路
萧述三骨DN乳腺癌复发 315年 197年 所有SZGR 2.0基因通路
乳腺癌萧述三腔的DN 564年 326年 所有SZGR 2.0基因通路
萧述三乳腺癌基底 648年 398年 所有SZGR 2.0基因通路
BOQUEST干细胞培养与新鲜 425年 298年 所有SZGR 2.0基因通路
西方肾上腺皮质肿瘤DN 546年 362年 所有SZGR 2.0基因通路
PODAR ADAPHOSTIN反应 147年 98年 所有SZGR 2.0基因通路
陈HOXA5目标9小时 223年 132年 所有SZGR 2.0基因通路
GRESHOCK癌症拷贝数 323年 240年 所有SZGR 2.0基因通路
BOYLAN多发性骨髓瘤C集群DN 32 21 所有SZGR 2.0基因通路
BOYLAN多发性骨髓瘤C DN 59 39 所有SZGR 2.0基因通路
SOUCEK MYC目标 8 6 所有SZGR 2.0基因通路
YOSHIMURA MAPK8目标了 1305年 895年 所有SZGR 2.0基因通路
60张及目标的人力资源 293年 203年 所有SZGR 2.0基因通路
米利伪足趋化性DN 457年 302年 所有SZGR 2.0基因通路
开罗肝母细胞癌DN 267年 160年 所有SZGR 2.0基因通路
田TNF通过NFKB信号没有 22 16 所有SZGR 2.0基因通路
黄成人组织干细胞模块 721年 492年 所有SZGR 2.0基因通路
CHANDRAN转移DN 306年 191年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒4 hr DN 254年 158年 所有SZGR 2.0基因通路
WHITFIELD细胞周期G2 182年 102年 所有SZGR 2.0基因通路
KARLSSON TGFB1目标了 127年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
DUTERTRE雌二醇响应24小时DN 505年 328年 所有SZGR 2.0基因通路
WIERENGA STAT5A目标了 217年 131年 所有SZGR 2.0基因通路
WIERENGA STAT5A目标GROUP2 60 38 所有SZGR 2.0基因通路
ACOSTA扩散独立MYC目标DN 116年 74年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标 1972年 1213年 所有SZGR 2.0基因通路
约翰斯通PARVB目标3 430年 288年 所有SZGR 2.0基因通路
通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 549年 316年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PASINI SUZ12目标 315年 215年 所有SZGR 2.0基因通路
赞美上帝FOXO3目标了 61年 41 所有SZGR 2.0基因通路
TORCHIA EWSR1 FLI1融合的目标 271年 165年 所有SZGR 2.0基因通路
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 824年 528年 所有SZGR 2.0基因通路
皮德森转移由ERBB2同种型7 403年 240年 所有SZGR 2.0基因通路
通过KDM3A KRIEG缺氧不 770年 480年 所有SZGR 2.0基因通路
马利克雌激素紧 12 10 所有SZGR 2.0基因通路
DN FORTSCHEGGER PHF8目标 784年 464年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PEDRIOLI MIR31目标 418年 245年 所有SZGR 2.0基因通路
冯氏TNF的目标了 63年 43 所有SZGR 2.0基因通路
冯氏TNF通过P38部分反应 160年 106年 所有SZGR 2.0基因通路
不是通过P38冯氏TNF响应 337年 236年 所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO FGFR1在前列腺癌模型的目标 289年 184年 所有SZGR 2.0基因通路
LIM乳腺干细胞DN 428年 246年 所有SZGR 2.0基因通路
斯米尔诺夫红外反应6小时DN 114年 69年 所有SZGR 2.0基因通路
ZWANG类1引起的暂时性的EGF 516年 308年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 181 389年 395年 m8 hsa - mir - 181 a大脑 AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 b深圳 AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG
hsa - mir - 181 c大脑 AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 d大脑 AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU
mir - 543 390年 396年 m8 hsa - mir - 543 AAACAUUCGCGGUGCACUUCU