基因页:SYNPR
概括?
基因 | 132204 |
象征 | SYNPR |
同义词 | Spo |
描述 | 突触蛋白 |
参考 | HGNC:HGNC:16507|Ensembl:ENSG00000163630|HPRD:15458|Vega:Otthumg00000158699 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P14.2 |
Pascal P值 | 0.022 |
Sherlock P值 | 0.983 |
主持人 | 小脑 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 胞吞作用 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17143455 | Chr10 | 8368252 | SYNPR | 132204 | 0.15 | 反式 | ||
RS9837015 | 3 | 63532822 | SYNPR | ENSG00000163630.6 | 1.07646E-6 | 0.02 | 318831 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SYNPR_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发12小时 | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |