基因页:Cox4i1
概括?
基因 | 1327 |
象征 | Cox4i1 |
同义词 | Cox IV-1 | Cox4 | Cox4-1 | Coxiv | Coxiv-1 |
描述 | 细胞色素C氧化酶亚基4i1 |
参考 | MIM:123864|HGNC:HGNC:2265|ENSEMBL:ENSG00000131143|HPRD:00466|Vega:Otthumg00000137649 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16q24.1 |
Pascal P值 | 0.07 |
Sherlock P值 | 0.026 |
胎儿β | -0.63 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Cox4i1 | CHR16 | 85840439 | G | 一个 | NM_001861 | p.157a> t | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16836102 | CHR4 | 4716366 | Cox4i1 | 1327 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/COX4I1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氧化磷酸化 | 135 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg心肌收缩 | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg阿尔茨海默氏病 | 169 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg帕金森氏病 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 | 141 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome呼吸电子传输 | 79 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组呼吸电子传输ATP通过化学含量耦合和热量产生通过解偶联蛋白来合成 | 98 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔卡拉凋亡 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌16q24 Amplicon | 53 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iizuka肝癌进展L0 L1 DN | 21 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Voxphos | 87 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
takao对UVB辐射的响应 | 86 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo卡路里限制肌肉DN | 87 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卫星对干扰素βdn的响应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对Cantharidin DN的反应 | 69 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1目标 | 90 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄线粒体基因模块 | 217 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gratias视网膜细胞瘤16Q24 | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
突变的TP53 DN的Stambolsky靶标 | 50 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病持续时间corr dn | 146 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Tial1目标 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
因宗乳腺干细胞向上 | 146 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |