概括
基因 132949
象征 AASDH
同义词 acsf4 | lys2 | nrps1098 | nrps998
描述 氨基磷酸 - 甲醛脱氢酶
参考 MIM:614365|HGNC:HGNC:23993|ENSEMBL:ENSG00000157426|HPRD:12398|Vega:Otthumg00000128841
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q12
Pascal P值 0.156
Sherlock P值 0.728
胎儿β 0.644
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DNM:Gulsuner_2013 整个外显子组测序分析 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
AASDH CHR4 57248732 t C NM_181806 p.88i> v 错过 精神分裂症 DNM:Gulsuner_2013

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02426410 4 57253603 AASDH 1.63E-8 -0.02 6.01E-6 DMG:JAFFE_2016
CG06649691 4 57254193 AASDH 9.92e-8 -0.013 2.2e-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17745470 CHR4 57080197 AASDH 132949 0.1 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg赖氨酸降解 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath NOS目标 179 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肢体芽中的schmidt por目标 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因