基因页:COX10
概括?
基因 | 1352 |
象征 | COX10 |
同义词 | - |
描述 | Cox10 Heme A:Farnesylsylansfrassy cytochrome C氧化酶组装因子 |
参考 | MIM:602125|HGNC:HGNC:2260|Ensembl:ENSG00000006695|HPRD:03673|Vega:Otthumg0000000058814 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p12 |
Pascal P值 | 0.092 |
Sherlock P值 | 0.836 |
胎儿β | 0.149 |
DMG | 2(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG27005118 | 17 | 13972210 | COX10 | 2.861E-4 | 0.484 | 0.039 | DMG:Wockner_2014 |
CG22956598 | 17 | 13973019 | COX10 | 2.27E-9 | -0.02 | 1.74E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/COX10_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TARBP1 | 0.45 | 0.38 |
PDIA2 | 0.43 | 0.31 |
plekh2 | 0.43 | 0.28 |
TAS2R49 | 0.43 | 0.28 |
sec31b | 0.43 | 0.34 |
AC022382.1 | 0.42 | 0.32 |
myo15b | 0.42 | 0.32 |
PLA2G4B | 0.42 | 0.29 |
AC008443.1 | 0.42 | 0.25 |
AC005841.1 | 0.41 | 0.22 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
gapdh | -0.24 | -0.21 |
SLC3A2 | -0.24 | -0.23 |
FBLN2 | -0.22 | -0.19 |
BTBD17 | -0.22 | -0.20 |
RASIP1 | -0.22 | -0.20 |
HLA-A | -0.22 | -0.25 |
Esam | -0.21 | -0.17 |
CHCHD9 | -0.21 | -0.22 |
S1PR4 | -0.21 | -0.20 |
BSG | -0.21 | -0.21 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氧化磷酸化 | 135 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg卟啉和叶绿素代谢 | 41 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿米特血清反应480 MCF10A | 39 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Voxphos | 87 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Tial1目标 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |