概括
基因 1352
象征 COX10
同义词 -
描述 Cox10 Heme A:Farnesylsylansfrassy cytochrome C氧化酶组装因子
参考 MIM:602125|HGNC:HGNC:2260|Ensembl:ENSG00000006695|HPRD:03673|Vega:Otthumg0000000058814
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p12
Pascal P值 0.092
Sherlock P值 0.836
胎儿β 0.149
DMG 2(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG27005118 17 13972210 COX10 2.861E-4 0.484 0.039 DMG:Wockner_2014
CG22956598 17 13973019 COX10 2.27E-9 -0.02 1.74E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TARBP1 0.45 0.38
PDIA2 0.43 0.31
plekh2 0.43 0.28
TAS2R49 0.43 0.28
sec31b 0.43 0.34
AC022382.1 0.42 0.32
myo15b 0.42 0.32
PLA2G4B 0.42 0.29
AC008443.1 0.42 0.25
AC005841.1 0.41 0.22
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
gapdh -0.24 -0.21
SLC3A2 -0.24 -0.23
FBLN2 -0.22 -0.19
BTBD17 -0.22 -0.20
RASIP1 -0.22 -0.20
HLA-A -0.22 -0.25
Esam -0.21 -0.17
CHCHD9 -0.21 -0.22
S1PR4 -0.21 -0.20
BSG -0.21 -0.21

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG氧化磷酸化 135 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg卟啉和叶绿素代谢 41 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿米特血清反应480 MCF10A 39 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Voxphos 87 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Tial1目标 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因