基因页:Cox11
概括?
基因 | 1353 |
象征 | Cox11 |
同义词 | Cox11p |
描述 | Cox11细胞色素C氧化酶铜伴侣蛋白 |
参考 | MIM:603648|HGNC:HGNC:2261|ENSEMBL:ENSG00000166260|HPRD:04709|Vega:Otthumg00000177838 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q22 |
Pascal P值 | 0.018 |
Sherlock P值 | 0.934 |
主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12949718 | CHR17 | 52981852 | Cox11 | 1353 | 1.025E-6 | 顺式 | ||
RS9899602 | CHR17 | 52986907 | Cox11 | 1353 | 7.22E-6 | 顺式 | ||
RS17745123 | CHR17 | 52988231 | Cox11 | 1353 | 2.977E-7 | 顺式 | ||
RS9910653 | CHR17 | 52992267 | Cox11 | 1353 | 2.351E-7 | 顺式 | ||
RS17817829 | CHR17 | 53010380 | Cox11 | 1353 | 0 | 顺式 | ||
RS12936860 | CHR17 | 53030225 | Cox11 | 1353 | 2.934E-6 | 顺式 | ||
RS17817950 | CHR17 | 53045324 | Cox11 | 1353 | 1.203E-4 | 顺式 | ||
RS7222197 | CHR17 | 53047498 | Cox11 | 1353 | 5.202E-4 | 顺式 | ||
RS2628305 | CHR17 | 53140426 | Cox11 | 1353 | 0 | 顺式 | ||
RS1484769 | CHR17 | 53166650 | Cox11 | 1353 | 0.01 | 顺式 | ||
RS244348 | CHR17 | 53196290 | Cox11 | 1353 | 0.02 | 顺式 | ||
RS244317 | CHR17 | 53216984 | Cox11 | 1353 | 0.01 | 顺式 | ||
RS2628316 | CHR17 | 53219836 | Cox11 | 1353 | 0.01 | 顺式 | ||
RS17711168 | CHR17 | 53225016 | Cox11 | 1353 | 0.07 | 顺式 | ||
RS11677557 | CHR2 | 121317746 | Cox11 | 1353 | 0.16 | 反式 | ||
RS12949718 | CHR17 | 52981852 | Cox11 | 1353 | 1.925E-4 | 反式 | ||
RS9899602 | CHR17 | 52986907 | Cox11 | 1353 | 0 | 反式 | ||
RS17745123 | CHR17 | 52988231 | Cox11 | 1353 | 6.089E-5 | 反式 | ||
SNP_A-2196622 | 0 | Cox11 | 1353 | 0.14 | 反式 | |||
RS9910653 | CHR17 | 52992267 | Cox11 | 1353 | 4.923E-5 | 反式 | ||
RS17817829 | CHR17 | 53010380 | Cox11 | 1353 | 0.11 | 反式 | ||
RS12936860 | CHR17 | 53030225 | Cox11 | 1353 | 5.068e-4 | 反式 | ||
RS17817950 | CHR17 | 53045324 | Cox11 | 1353 | 0.01 | 反式 | ||
RS7222197 | CHR17 | 53047498 | Cox11 | 1353 | 0.04 | 反式 | ||
RS8064931 | 0 | Cox11 | 1353 | 0.16 | 反式 | |||
RS2628305 | CHR17 | 53140426 | Cox11 | 1353 | 0.13 | 反式 | ||
RS10415150 | CHR19 | 52604624 | Cox11 | 1353 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/COX11_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DMXL1 | 0.93 | 0.91 |
UBR3 | 0.92 | 0.90 |
WDR7 | 0.92 | 0.91 |
TMEM30A | 0.91 | 0.91 |
ATG2B | 0.90 | 0.89 |
DMXL2 | 0.90 | 0.89 |
Col4a3bp | 0.90 | 0.89 |
hipk3 | 0.90 | 0.91 |
CXORF39 | 0.90 | 0.90 |
AKAP11 | 0.90 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C1orf61 | -0.50 | -0.63 |
AL022328.1 | -0.47 | -0.53 |
C1orf54 | -0.46 | -0.51 |
Rab34 | -0.46 | -0.53 |
增强 | -0.46 | -0.51 |
AF347015.21 | -0.45 | -0.45 |
C19orf36 | -0.44 | -0.51 |
SAT1 | -0.44 | -0.48 |
EIF4EBP3 | -0.44 | -0.50 |
FXYD1 | -0.43 | -0.45 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氧化磷酸化 | 135 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血髓样DN | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN | 116 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 | 170 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Voxphos | 87 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭雷帕霉素反应dn | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄线粒体基因模块 | 217 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |