概括
基因 1353
象征 Cox11
同义词 Cox11p
描述 Cox11细胞色素C氧化酶铜伴侣蛋白
参考 MIM:603648|HGNC:HGNC:2261|ENSEMBL:ENSG00000166260|HPRD:04709|Vega:Otthumg00000177838
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q22
Pascal P值 0.018
Sherlock P值 0.934
主持人 皮质
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12949718 CHR17 52981852 Cox11 1353 1.025E-6 顺式
RS9899602 CHR17 52986907 Cox11 1353 7.22E-6 顺式
RS17745123 CHR17 52988231 Cox11 1353 2.977E-7 顺式
RS9910653 CHR17 52992267 Cox11 1353 2.351E-7 顺式
RS17817829 CHR17 53010380 Cox11 1353 0 顺式
RS12936860 CHR17 53030225 Cox11 1353 2.934E-6 顺式
RS17817950 CHR17 53045324 Cox11 1353 1.203E-4 顺式
RS7222197 CHR17 53047498 Cox11 1353 5.202E-4 顺式
RS2628305 CHR17 53140426 Cox11 1353 0 顺式
RS1484769 CHR17 53166650 Cox11 1353 0.01 顺式
RS244348 CHR17 53196290 Cox11 1353 0.02 顺式
RS244317 CHR17 53216984 Cox11 1353 0.01 顺式
RS2628316 CHR17 53219836 Cox11 1353 0.01 顺式
RS17711168 CHR17 53225016 Cox11 1353 0.07 顺式
RS11677557 CHR2 121317746 Cox11 1353 0.16 反式
RS12949718 CHR17 52981852 Cox11 1353 1.925E-4 反式
RS9899602 CHR17 52986907 Cox11 1353 0 反式
RS17745123 CHR17 52988231 Cox11 1353 6.089E-5 反式
SNP_A-2196622 0 Cox11 1353 0.14 反式
RS9910653 CHR17 52992267 Cox11 1353 4.923E-5 反式
RS17817829 CHR17 53010380 Cox11 1353 0.11 反式
RS12936860 CHR17 53030225 Cox11 1353 5.068e-4 反式
RS17817950 CHR17 53045324 Cox11 1353 0.01 反式
RS7222197 CHR17 53047498 Cox11 1353 0.04 反式
RS8064931 0 Cox11 1353 0.16 反式
RS2628305 CHR17 53140426 Cox11 1353 0.13 反式
RS10415150 CHR19 52604624 Cox11 1353 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DMXL1 0.93 0.91
UBR3 0.92 0.90
WDR7 0.92 0.91
TMEM30A 0.91 0.91
ATG2B 0.90 0.89
DMXL2 0.90 0.89
Col4a3bp 0.90 0.89
hipk3 0.90 0.91
CXORF39 0.90 0.90
AKAP11 0.90 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf61 -0.50 -0.63
AL022328.1 -0.47 -0.53
C1orf54 -0.46 -0.51
Rab34 -0.46 -0.53
增强 -0.46 -0.51
AF347015.21 -0.45 -0.45
C19orf36 -0.44 -0.51
SAT1 -0.44 -0.48
EIF4EBP3 -0.44 -0.50
FXYD1 -0.43 -0.45

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG氧化磷酸化 135 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血髓样DN 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN 116 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Voxphos 87 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素反应dn 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄线粒体基因模块 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因