概括
基因 1356
象征 CP
同义词 CP-2
描述 谷蛋白酶(铁氧化酶)
参考 MIM:117700|HGNC:HGNC:2295|Ensembl:ENSG0000000047457|HPRD:00317|Vega:Otthumg00000159563
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q23-Q25
Pascal P值 0.083
胎儿β -1.281
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1390870 CHR15 47754311 CP 1356 0.07 反式
RS4407004 CHR15 47754781 CP 1356 0.09 反式
RS12440759 CHR15 47804268 CP 1356 0.12 反式
RS11070591 CHR15 47816373 CP 1356 0.09 反式
RS12592568 CHR15 47864297 CP 1356 0.05 反式
RS16959700 CHR15 47872280 CP 1356 0.04 反式
RS12438247 CHR15 47892504 CP 1356 0.03 反式
RS16959883 CHR15 47911262 CP 1356 0.05 反式
RS6598553 CHR15 99339208 CP 1356 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FOLR1 0.79 0.38
KRT8P9 0.74 0.31
clic6 0.73 0.28
CP 0.72 0.37
KCNJ13 0.70 0.27
F5 0.69 0.20
prlr 0.69 0.23
SLC5A5 0.68 0.07
RBM47 0.68 0.25
SLC13A4 0.68 0.06
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Cidea -0.19 -0.24
chrdl1 -0.18 -0.21
DPP4 -0.18 -0.26
MEF2C -0.18 -0.27
IER5L -0.17 -0.23
arl4d -0.17 -0.23
EPHB6 -0.16 -0.16
GTDC1 -0.16 -0.21
TM6SF1 -0.16 -0.23
AC008073.2 -0.16 -0.20

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg卟啉和叶绿素代谢 41 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF1 TFPathway 66 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 89 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组金属离子SLC转运蛋白 22 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome铁吸收和运输 36 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与导管正常DN 198 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与导管正常DN 91 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向 456 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标8小时DN 129 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno岩石信号不是通过Rhoa Up 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1慢性LOF DN 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 211 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向E 97 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低DN 165 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高DN 180 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌DN 181 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Khetchoumian Trim24靶向 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ingram SHH目标 127 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mantovani NFKB目标 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mantovani病毒GPCR信号向上 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌E 89 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Houstis Ros 36 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移DN 121 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化新皮层DN 80 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruan对TNF的反应 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈里斯缺氧 81 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruan对TNF Troglitazone的反应 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由HPV31 UP永生 84 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Semenza HIF1目标 36 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheng对醋酸镍的反应 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zamora NOS2靶向DN 96 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Jnk Singaling DN 39 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 77 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和内皮的钟分泌组 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kondo EZH2目标 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄线粒体基因模块 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由Kras Pten Up 181 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑中的Smid乳腺癌复发 39 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pleura DN中的Smid乳腺癌复发 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向DN 108 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
路德维切克治疗铁超负荷 7 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 DN 170 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未经注释 85 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 128 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA1 UP 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC LCP带有H3K4ME3 58 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stambolsky对维生素D3的反应 84 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Steger脂肪生成 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标3 DN 39 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VHL的Wacker缺氧靶标 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix RAR目标 48 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因