概括
基因 135644
象征 TRIM40
同义词 RNF35
描述 包含40个的三方图案
参考 HGNC:HGNC:18736|Ensembl:ENSG00000204614|HPRD:15557|Vega:Otthumg00000031083
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p22.1
Pascal P值 1.088e-14
胎儿β 0.537
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG10848828 6 30104295 TRIM40 1.217E-4 -0.356 0.03 DMG:Wockner_2014
CG00987918 6 30115829 TRIM40 3.664E-4 -0.31 0.042 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K4Me3 162 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因