概括
基因 1362
象征 CPD
同义词 GP180
描述 羧肽酶d
参考 MIM:603102|HGNC:HGNC:2301|ENSEMBL:ENSG00000108582|HPRD:04375|Vega:Otthumg00000132797
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q11.2
Pascal P值 3.708E-4
胎儿β -0.627
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AP006216.1 0.84 0.84
CCDC47 0.84 0.81
LAMP1 0.83 0.80
SPTLC2 0.83 0.85
Lancl1 0.82 0.79
FAM55C 0.81 0.83
sort1 0.81 0.83
NFE2L1 0.81 0.82
trappc10 0.81 0.81
PTPDC1 0.81 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf61 -0.56 -0.55
C1orf54 -0.53 -0.46
AF347015.21 -0.53 -0.41
Sycp3 -0.52 -0.49
GNG11 -0.49 -0.44
IL32 -0.49 -0.48
AL050337.1 -0.49 -0.41
C16orf74 -0.49 -0.49
DBI -0.48 -0.50
clec2b -0.48 -0.38

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004185 丝氨酸型羧肽酶活性 塔斯 谷氨酸(GO期限:8) 9064476
去:0004181 金属羧肽酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
去:0008237 金属肽酶活性 IEA -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005624 膜分数 塔斯 9064476
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome膜贩运 129 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 60 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Golgi相关囊泡生物发生 53 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多恩乳腺癌课程 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer Pthlh靶向 112 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 137 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房5 6WK DN 137 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AIYAR COBRA1靶向DN 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS ELK3靶向 27 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 110 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A DN的缺氧总缺氧 103 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素的反应 86 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞的发育 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL CBP融合的王目标 44 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌ERBB2 UP 147 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞DN 145 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mir15a和mir16 1的Bonci目标 91 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G123 UP 45 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn暂时TGFB1签名 109 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信号24小时 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S2 115 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇0的时间反应0 76 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 134 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 106 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 633 639 M8 HSA-LET-7A ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I ugagguaguugugugugugcugu
mir-124/506 3704 3710 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-128 3700 3706 M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-135 2308 2315 1A,M8 HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-141/200a 2338 2344 M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-148/152 3698 3704 M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-15/16/195/424/497 1407 1413 M8 HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-150 55 62 1A,M8 HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-181 2201 2208 1A,M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-19 970 976 1a HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-196 632 638 M8 HSA-MIR-196A uagguaguucauguugugug
HSA-MIR-196B uagguaguucuuguugg
mir-204/211 3727 3733 M8 HSA-MIR-204 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
mir-214 1409 1415 1a HSA-MIR-214 acagcaggcacagacaggcag
mir-23 3781 3787 1a HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-27 815 821 1a HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-320 417 423 1a HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-331 1429 1435 1a HSA-MIR-331 gccccugggccuauccuagaa
mir-370 621 627 1a HSA-MIR-370 gccugggggguggaaccugg
mir-496 3447 3453 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-543 1387 1393 M8 HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu