Summary
GeneID 136319
象征 mtpn
同义词 GCDP | V-1
描述 肌营养素
参考 MIM:606484|HGNC:HGNC:15667|ENSEMBL:ENSG00000105887|HPRD:07574|Vega:Otthumg00000155627
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7Q33
Sherlock P值 9.733e-5
胎儿β -0.386
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 点击neuro-related关键words: 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1570589 Chr9 116874354 mtpn 136319 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 nas 12031792
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0030182 神经元分化 nas 神经元(GO期限:8) 12031792
去:0006417 翻译调节 nas 12031792
GO:0016049 细胞生长 nas 12031792
GO:0016202 条纹肌肉发育的调节 nas 12031792
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005575 cellular_component nd -
去:0005622 细胞内 艾达 11256614
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Rashi对电离辐射4的响应4 61 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 143 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足趋化趋化性 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期M G1 148 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 1410 1416 1a HSA-LET-7A ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
HSA-LET-7E ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I ugagguaguugugugugugcugu
mir-1/206 720 726 1a HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-124.1 460 467 1A,M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 460 466 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-135 828 834 1a HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG
miR-136 2948 2955 1A,M8 HSA-MIR-136 Acuccauuuuuuugaugaugaugga
miR-137 439 445 M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-141/200a 2893 2899 M8 HSA-MIR-141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-143 2439 2445 1a HSA-MIR-143 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-144 3107 3113 M8 HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-181 1404 1411 1A,M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-186 944 950 M8 HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-217 2132 2139 1A,M8 HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
mir-219 1719年 1725年 1a HSA-MIR-219 ugauuguccaaacgcaauucu
mir-223 666 672 M8 hsa-miR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-26 3150 3156 1a HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
mir-330 2996 3002 M8 HSA-MIR-330 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-338 601 607 1a HSA-MIR-338 uccagauuuuuguuga
miR-375 3135 3141 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga
mir-381 2829 2835 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-410 762 768 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-493-5p 3085 3091 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-539 3063 3069 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
miR-542-3p 67 73 M8 HSA-MIR-542-3P ugugacauugauaacugaaa
mir-9 996 1002 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga