基因页:mtpn
Summary?
GeneID | 136319 |
象征 | mtpn |
同义词 | GCDP | V-1 |
描述 | 肌营养素 |
参考 | MIM:606484|HGNC:HGNC:15667|ENSEMBL:ENSG00000105887|HPRD:07574|Vega:Otthumg00000155627 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q33 |
Sherlock P值 | 9.733e-5 |
胎儿β | -0.386 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 点击neuro-related关键words: 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1570589 | Chr9 | 116874354 | mtpn | 136319 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MTPN_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | nas | 12031792 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0030182 | 神经元分化 | nas | 神经元(GO期限:8) | 12031792 |
去:0006417 | 翻译调节 | nas | 12031792 | |
GO:0016049 | 细胞生长 | nas | 12031792 | |
GO:0016202 | 条纹肌肉发育的调节 | nas | 12031792 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005575 | cellular_component | nd | - | |
去:0005622 | 细胞内 | 艾达 | 11256614 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Rashi对电离辐射4的响应4 | 61 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 | 174 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足趋化趋化性 | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
Let-7/98 | 1410 | 1416 | 1a | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
HSA-LET-7D脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
HSA-MIR-98脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
mir-1/206 | 720 | 726 | 1a | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-124.1 | 460 | 467 | 1A,M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-124/506 | 460 | 466 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
miR-135 | 828 | 834 | 1a | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
HSA-MIR-135B | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
miR-136 | 2948 | 2955 | 1A,M8 | HSA-MIR-136 | Acuccauuuuuuugaugaugaugga |
miR-137 | 439 | 445 | M8 | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag | ||||
mir-141/200a | 2893 | 2899 | M8 | HSA-MIR-141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
mir-143 | 2439 | 2445 | 1a | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
mir-144 | 3107 | 3113 | M8 | HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
mir-181 | 1404 | 1411 | 1A,M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-186 | 944 | 950 | M8 | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
mir-217 | 2132 | 2139 | 1A,M8 | HSA-MIR-217 | uacugcaucagaacugauuggau |
mir-219 | 1719年 | 1725年 | 1a | HSA-MIR-219脑 | ugauuguccaaacgcaauucu |
mir-223 | 666 | 672 | M8 | hsa-miR-223 | ugucuuugucaauacccc |
mir-26 | 3150 | 3156 | 1a | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
HSA-MIR-26BSZ | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
mir-330 | 2996 | 3002 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
mir-338 | 601 | 607 | 1a | HSA-MIR-338脑 | uccagauuuuuguuga |
miR-375 | 3135 | 3141 | 1a | HSA-MIR-375 | uuuguucguucggcucgcguga |
mir-381 | 2829 | 2835 | 1a | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
mir-410 | 762 | 768 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
mir-493-5p | 3085 | 3091 | M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
mir-539 | 3063 | 3069 | 1a | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |
miR-542-3p | 67 | 73 | M8 | HSA-MIR-542-3P | ugugacauugauaacugaaa |
mir-9 | 996 | 1002 | M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |