Summary
GeneID 1374
象征 CPT1A
同义词 CPT1 | CPT1-L | L-CPT1
描述 肉碱棕榈转移酶1A
参考 MIM:600528|HGNC:HGNC:2328|Ensembl:ENSG00000110090|HPRD:02755|Vega:Otthumg00000167892
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q13.2
Pascal P值 0.136
胎儿β -0.398
DMG 2(#研究)
主持人

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Montano_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 3
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.366
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG20562447 11 68611596 CPT1A 2.53E-4 0.004 0.171 DMG:Montano_2016
CG20228509 11 68609166 CPT1A 3.694E-4 -0.195 0.043 DMG:Wockner_2014
CG13786863 11 68610743 CPT1A 4.889E-4 0.378 0.047 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004095 carnitine O-palmitoyltransferase activity 塔斯 7892212
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
GO:0008415 酰基转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006810 transport IEA -
去:0006635 脂肪酸β-氧化 塔斯 7892212
去:0006631 脂肪酸代谢过程 IEA -
去:0006629 脂质代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005739 线粒体 塔斯 7892212
去:0005741 mitochondrial outer membrane IEA -
GO:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg脂肪酸代谢 42 29 所有SZGR2.0 genes in this pathway
kegg ppar信号通路 69 47 所有SZGR2.0 genes in this pathway
KEGG脂肪细胞信号传导途径 67 57 所有SZGR2.0 genes in this pathway
生物卡塔尔瘦素途径 11 11 所有SZGR2.0 genes in this pathway
PID HNF3B途径 45 37 所有SZGR2.0 genes in this pathway
反应组激活的AMPK刺激肌肉中的脂肪酸氧化 19 16 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Reactome Ppara激活基因表达 104 72 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Reactome Rora激活昼夜节律表达 24 17 所有SZGR2.0 genes in this pathway
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 所有SZGR2.0 genes in this pathway
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 所有SZGR2.0 genes in this pathway
REACTOME CIRCADIAN CLOCK 53 40 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Liu Sox4靶向DN 309 191 所有SZGR2.0 genes in this pathway
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 所有SZGR2.0 genes in this pathway
HUTTMANN B CLL POOR SURVIVAL UP 276 187 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Bilban b cll lpl up 63 39 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Jaatinen造血干细胞向上 316 190 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 所有SZGR2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房4 5WK 271 175 所有SZGR2.0 genes in this pathway
YANG乳腺癌ESR1激光升高 34 25 所有SZGR2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 所有SZGR2.0 genes in this pathway
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 所有SZGR2.0 genes in this pathway
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 所有SZGR2.0 genes in this pathway
buytaert光动力疗法压力 811 508 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Caffarel对THC 24小时3 DN的响应 13 8 所有SZGR2.0 genes in this pathway
里克曼头颈癌C 113 47 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Benporath Nanog目标 988 594 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Benporath Oct4目标 290 172 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Benporath SOX2目标 734 436 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Benporath NOS目标 179 105 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon 158 93 所有SZGR2.0 genes in this pathway
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 所有SZGR2.0 genes in this pathway
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 77 48 所有SZGR2.0 genes in this pathway
PAL PRMT5靶向 203 135 所有SZGR2.0 genes in this pathway
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 所有SZGR2.0 genes in this pathway
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 所有SZGR2.0 genes in this pathway
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 所有SZGR2.0 genes in this pathway
黄线粒体基因模块 217 122 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Martinez RB1靶向DN 543 317 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Martinez TP53目标DN 593 372 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Sarrio上皮间质转变 180 114 所有SZGR2.0 genes in this pathway
安布罗西尼FLAVOPIRIDOL治疗TP53 109 63 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Bredemeyer抹布通过ATM而不是通过NFKB DN发出的信号 38 23 所有SZGR2.0 genes in this pathway
MOOTHA HUMAN MITODB 6 2002 429 260 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Mootha PGC 420 269 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Mootha线粒体 447 277 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Stein Esrra目标 535 325 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Mootha FFA氧气 22 13 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Zembutsu对长春新碱的敏感性 19 10 所有SZGR2.0 genes in this pathway
BAKKER FOXO3 TARGETS UP 61 41 所有SZGR2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 所有SZGR2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 152 88 所有SZGR2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 所有SZGR2.0 genes in this pathway
杨Bcl3靶向 364 236 所有SZGR2.0 genes in this pathway
IRS1和IRS2的GUO目标 98 67 所有SZGR2.0 genes in this pathway
Guillaumond KLF10靶向 51 39 所有SZGR2.0 genes in this pathway