基因页:CPT1B
概括?
基因 | 1375 |
象征 | CPT1B |
同义词 | CPT1-M | CPT1M | CPTI | CPTI-M | M-CPT1 | MCCPT1 | MCPT1 |
描述 | 肉碱棕榈转移酶1B |
参考 | MIM:601987|HGNC:HGNC:2329|Ensembl:ENSG00000205560|HPRD:09065|Vega:Otthumg00000137390 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q13.33 |
Sherlock P值 | 0.005 |
胎儿β | 0.758 |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | CPT1B | 1375 | 0.12 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | CPT1B | 1375 | 0 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CPT1B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tesk1 | 0.88 | 0.88 |
BCKDK | 0.85 | 0.83 |
AGPAT1 | 0.84 | 0.82 |
Keap1 | 0.84 | 0.85 |
KIAA1539 | 0.83 | 0.87 |
LRRN2 | 0.83 | 0.83 |
C7orf43 | 0.83 | 0.82 |
SCAMP3 | 0.82 | 0.79 |
scap | 0.82 | 0.82 |
鸽子 | 0.82 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.66 | -0.66 |
AF347015.31 | -0.60 | -0.56 |
MT-CO2 | -0.58 | -0.57 |
AF347015.27 | -0.58 | -0.56 |
AF347015.8 | -0.56 | -0.55 |
AL050337.1 | -0.56 | -0.57 |
GNG11 | -0.56 | -0.54 |
mt-cyb | -0.54 | -0.51 |
Sycp3 | -0.53 | -0.53 |
鼻孔 | -0.53 | -0.51 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg脂肪酸代谢 | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg ppar信号通路 | 69 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG脂肪细胞信号传导途径 | 67 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta PPARA途径 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID HNF3B途径 | 45 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组激活的AMPK刺激肌肉中的脂肪酸氧化 | 19 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇3 DN | 229 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FLI1和DAX1的Garcia目标 | 57 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病DN | 121 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FAELT B CLL与VH重新排列 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JI对FSH的响应 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 | 104 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stambolsky被突变的TP53绑定 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙血清敏感基因 | 90 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bilanges血清反应翻译 | 37 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
桑德森PPARA目标 | 15 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |