基因页:CPT2
概括?
基因 | 1376年 |
象征 | CPT2 |
同义词 | cpt1 | cptase | iiae4 |
描述 | 肉碱棕榈转移酶2 |
参考 | MIM:600650|HGNC:HGNC:2330|ENSEMBL:ENSG00000157184|HPRD:02802|Vega:Otthumg00000008942 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 132 |
Pascal P值 | 0.006 |
Sherlock P值 | 5.752e-5 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7918436 | Chr10 | 55893205 | CPT2 | 1376年 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CPT2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZNF148 | 0.95 | 0.97 |
RBM27 | 0.94 | 0.96 |
PHF6 | 0.94 | 0.94 |
NCBP1 | 0.93 | 0.93 |
KLH9 | 0.93 | 0.94 |
RSBN1 | 0.93 | 0.96 |
lass6 | 0.93 | 0.94 |
TNPO1 | 0.93 | 0.94 |
Nras | 0.93 | 0.93 |
ZFP14 | 0.93 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.67 | -0.84 |
MT-CO2 | -0.65 | -0.81 |
AF347015.31 | -0.64 | -0.80 |
AIFM3 | -0.64 | -0.71 |
ifi27 | -0.63 | -0.80 |
AF347015.33 | -0.63 | -0.77 |
AC018755.7 | -0.63 | -0.70 |
TSC22D4 | -0.62 | -0.73 |
higd1b | -0.62 | -0.81 |
S100B | -0.62 | -0.74 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg脂肪酸代谢 | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg ppar信号通路 | 69 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组激活的AMPK刺激肌肉中的脂肪酸氧化 | 19 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Ppara激活基因表达 | 104 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gal白血病干细胞向上 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤65 DN | 37 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
landis erbb2乳房肿瘤型DN | 55 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN | 149 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Galluzzi通透性线粒体 | 43 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3 UP总缺氧 | 209 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gotzmann上皮到间充质过渡dn | 206 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc TGFA DN | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Dena DN | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ruan对Troglitazone的反应 | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Varela ZMPSTE24靶向DN | 38 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUAN对TNF DN的反应 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成5 | 126 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold脂肪形成 | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 | 159 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha FFA氧气 | 22 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 | 152 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
桑德森PPARA目标 | 15 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |