基因页:C9orf116
概括?
基因 | 138162 |
象征 | C9orf116 |
同义词 | Pierce1 | rbest47 |
描述 | 染色体9开放阅读框116 |
参考 | MIM:614502|HGNC:HGNC:28435|ENSEMBL:ENSG00000160345|HPRD:12937|Vega:Otthumg00000020902 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9Q34.3 |
Pascal P值 | 0.019 |
Sherlock P值 | 0.317 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SNP_A-2086527 | 0 | C9orf116 | 138162 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/C9orf116_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane乳腺癌ESR1 UP | 112 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮 | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gottwein的KSHV Mir K12 11 | 63 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对甲氨蝶呤的反应 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Brachat对Camptothecin的反应 | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼中的Smid乳腺癌复发 | 97 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔内B | 172 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 UP | 167 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1通过NFIC 10小时信号传导 | 54 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向 | 279 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |