总结吗?
GeneID 1387年
象征 CREBBP
同义词 海关与边境保护局| KAT3A | rst
描述 结合蛋白分子
参考 MIM: 600140|HGNC: HGNC: 2348|运用:ENSG00000005339|HPRD: 02534|织女:OTTHUMG00000129431
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 16 p13.3
帕斯卡假定值 0.019
夏洛克假定值 0.399
胎儿β 1.687
支持 CompositeSet
达内尔FMRP目标
染色质重塑基因

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.0553

部分即遗传学和表观遗传学注释


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
C10orf116 0.72 0.82
TAGLN 0.72 0.78
VAMP5 0.71 0.86
MYL9 0.70 0.78
RHOC 0.70 0.74
GSDMD 0.69 0.75
METRN 0.69 0.80
基本 0.69 0.81
MUSTN1 0.68 0.80
SERPINB6 0.68 0.78
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
RNF214 -0.59 -0.80
TTC3 -0.58 -0.80
NFX1 -0.58 -0.79
TCERG1 -0.58 -0.81
ANKRD17 -0.58 -0.77
TMEM81 -0.58 -0.79
CKAP5 -0.58 -0.79
TOPBP1 -0.58 -0.78
C10orf137 -0.58 -0.79
SMARCC2 -0.58 -0.78

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0004871 信号传感器活动 助教 7913207|8028671
去:0003677 DNA结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0003700 转录因子的活动 助教 7913207
去:0003713 转录辅激活活动 艾达 12435739|12586840
去:0003713 转录辅激活活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0003713 转录辅激活活动 新闻学会 8684459
去:0005515 蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0005524 ATP结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0004402 组蛋白乙酰转移酶的活动 艾达 11742995
去:0004402 组蛋白乙酰转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0016740 转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0016887 腺苷三磷酸酶活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0016407 乙酰转移酶活性 艾达 11742995
去:0016407 乙酰转移酶活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0051577 MyoD绑定 艾达 8621548
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0001666 应对缺氧 助教 15261140
去:0006355 依赖dna的转录调节 艾达 12169688
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0006461 蛋白质复合体组装 助教 7913207
去:0007165 信号转导 NAS 15261140
去:0018076 氨基端peptidyl-lysine乙酰化作用 艾达 12435739
去:0016573 组蛋白乙酰化作用 艾达 11742995
去:0016573 组蛋白乙酰化作用 国际能源机构 - - - - - -
去:0042592 自我平衡的过程 NAS 15261140
去:0045893 积极的调控转录,依赖dna的 国际能源机构 - - - - - -
去:0045941 积极的转录调节 艾达 11742995
去:0045941 积极的转录调节 国际空间站 - - - - - -
去:0044419 生物种间相互作用 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000123 组蛋白乙酰转移酶复杂 国际能源机构 - - - - - -
去:0000940 外冷凝染色体的着丝粒 国际能源机构 - - - - - -
去:0005634 集成电路 12169688
去:0005634 国际能源机构 - - - - - -
去:0005737 细胞质 助教 7913207
去:0016605 PML的身体 艾达 17332504

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
ABCA1 ABC-1 |他们| CERP | FLJ14958 | HDLDT1 | MGC164864 | MGC165011 | TGD 磷酸腺苷磁带,sub-family(他们),成员1 亲和力Capture-Western BioGRID 11864601
亚耳河 AIRE1 | apec | APS1 | APSI | PGA1 自身免疫调节器 - - - - - - HPRD, BioGRID 10748110
亚耳河 AIRE1 | apec | APS1 | APSI | PGA1 自身免疫调节器 涂画或同种型1与CBP交互 绑定 10748110
ALX1 CART1 ALX同源框1 - - - - - - HPRD 12929931
基于“增大化现实”技术 AIS | DHTR | HUMARA | KD | NR3C4 | SBMA | SMAX1 |解冻 雄性激素受体 - - - - - - HPRD, BioGRID 9482849
ATF1 EWS-ATF1 |付/ ATF-1 | TREB36 激活转录因子1 - - - - - - HPRD, BioGRID 8663317
ATF2 CRE-BP1 | CREB2 | HB16 | MGC111558 | TREB7 激活转录因子2 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 9786917
ATF4 CREB-2 | CREB2 | TAXREB67 | TXREB 激活转录因子4 (tax-responsive增强器元素B67) 重新组成复杂 BioGRID 9295363
BCL3 BCL4 | D19S37 b细胞慢性淋巴细胞白血病/淋巴瘤3 - - - - - - HPRD 10497212
BNIP3L BNIP3a |无 BCL2 /腺病毒E1B 19 kda蛋白质存在正交互 海关与边境保护局与Bnip3L交互。 绑定 15607964
乳腺癌易感基因1 虹膜BRCAI | BRCC1 | | PSCP | RNF53 早发性乳腺癌 - - - - - - HPRD, BioGRID 10655477
乳腺癌易感基因1 虹膜BRCAI | BRCC1 | | PSCP | RNF53 早发性乳腺癌 海关与边境保护局与BRCA1。这种交互是仿照人类BRCA1和鼠标CBP证明之间的交互。 绑定 10655477
国家气候变化委员会 CycC 细胞周期蛋白C Co-fractionation BioGRID 9710619
CCND1 BCL1 | D11S287E | PRAD1 | U21B31 细胞周期蛋白D1 CBP与周期蛋白D1的启动子。 绑定 15808510
CDC25B - - - - - - 细胞分裂周期25同族体B (s .非洲酒) - - - - - - HPRD 11689696
CDK8 K35 | MGC126074 | MGC126075 细胞周期蛋白依赖性激酶8 亲和力Capture-Western
Co-fractionation
BioGRID 9710619
CDKN1A P21 CAP20 | CDKN1 | CIP1 | MDA-6 | | SDI1 | WAF1 | p21CIP1 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1 (p21 Cip1) p21 CREBBP (CBP)与启动子。 绑定 15710329
CDKN1A P21 CAP20 | CDKN1 | CIP1 | MDA-6 | | SDI1 | WAF1 | p21CIP1 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1 (p21 Cip1) 海关与边境保护局p21和交互。 绑定 10764767
CDX2 CDX-3 | CDX3 尾型同源框2 - - - - - - HPRD, BioGRID 10066780
CITED1 MSG1 海关与边境保护局/ p300-interacting反式激活因子,Glu / Asp-rich carboxy-terminal域,1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10722728
CITED2 MRG1 | P35SRJ 海关与边境保护局/ p300-interacting反式激活因子,Glu / Asp-rich carboxy-terminal域,2 - - - - - - HPRD, BioGRID 9887100
CREB1 分子| MGC9284 营反应元件结合蛋白1 CREB1(分子)与CREBBP (CBP)。 绑定 16007092
CREB1 分子| MGC9284 营反应元件结合蛋白1 海关与边境保护局与分子相互作用。 绑定 15454081
CREB1 分子| MGC9284 营反应元件结合蛋白1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9413984
CREBBP 海关与边境保护局| KAT3A | rst 结合蛋白分子 - - - - - - HPRD 11259575
埋头 MGC117393 c - src酪氨酸激酶 - - - - - - HPRD, BioGRID 10801129
CSNK2A1 CK2A1 | CKII 酪蛋白激酶2,α1多肽 - - - - - - HPRD, BioGRID 9685505
CSNK2A2 CK2A2 | CSNK2A1 | FLJ43934 酪蛋白激酶2α'多肽 - - - - - - HPRD, BioGRID 9685505
CTBP1 酒吧| MGC104684 c端结合蛋白1 CTBP1与CREBBP (CBP) 绑定 15834423
CTNNB1 CTNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 β连环蛋白(cadherin-associated蛋白质),88 kda 表型增强 BioGRID 15782138
CUX1 CASP | CDP | CDP /切割| CDP1 | COY1 | CUTL1 | CUX | Clox | CUX / CDP | GOLIM6 | Nbla10317 | p100 | p110 | p200 |我 如一把同源框1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10852958
DAXX BING2 | DAP6 | EAP1 | MGC126245 | MGC126246 死亡域相关的蛋白质 海关与边境保护局与Daxx交互。 绑定 11799127
DDX5 DKFZp686J01190 | G17P1 | HLR1 | HUMP68 | 2 死(Asp-Glu-Ala-Asp)框多肽5 - - - - - - HPRD, BioGRID 12527917
E2F1 E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 E2F转录因子1 2台混合动力 BioGRID 12748276
E2F3 DKFZp686C18211 | E2F-3 | KIAA0075 | MGC104598 E2F转录因子3 2台混合动力 BioGRID 12748276
EBF1 COE1 | EBF | FLJ39389 | FLJ41763 | O / e 1 | OLF1 早期的b细胞因子1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12748286
EGR1 AT225 | G0S30 | KROX-24 | ngfi - a | TIS8 | zif - 268 | ZNF225 早期生长反应1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9806899
EGR1 AT225 | G0S30 | KROX-24 | ngfi - a | TIS8 | zif - 268 | ZNF225 早期生长反应1 CBP与Egr1启动子。 绑定 15225550
EGR1 AT225 | G0S30 | KROX-24 | ngfi - a | TIS8 | zif - 268 | ZNF225 早期生长反应1 CBP启动子与Egr1交互。 绑定 15225550
ESR1 ER DKFZp686N23123 | | ESR |将有关| |时代NR3A1 雌激素受体1 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 11113179|11782371
邪恶 AML1-EVI-1 | EVI-1 | MDS1-EVI1 | MGC163392 | PRDM3 同向性病毒整合位点1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11568182
EWSR1 EWS 尤因肉瘤断点地区1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12459554
”丛书 AP-1 | C-FOS v-fos FBJ小鼠骨肉瘤病毒致癌基因相同器官 重新组成复杂 BioGRID 11782371
FOXO1 FKH1 | FKHR | FOXO1A forkhead盒O1群 - - - - - - HPRD, BioGRID 10973497
FOXO4 AFX | AFX1 | MGC120490 | MLLT7 forkhead盒O4 - - - - - - HPRD, BioGRID 10973497
GATA1 ERYF1 | GF-1 | GF1 | NFE1 叫结合蛋白1(球蛋白转录因子1) 重新组成复杂 BioGRID 12496368
激活 爸爸acl | gcp | PAP-A | | PAPA1 | PAPB |小灵通| PPDIV GLI-Kruppel家庭成员激活 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 10075717
GTF2B TF2B | TFIIB IIB通用转录因子 重新组成复杂 BioGRID 11782371|11864601
H3F3A H3.3A | H3F3 | MGC87782 | MGC87783 H3组蛋白、家庭3 H3F3A(组3)与CREBBP (CBP)。 绑定 15616580
HIF1A HIF-1alpha | HIF1 | HIF1-ALPHA | MOP1 | PASD8 低氧诱导因子1α亚基(基本helix-loop-helix转录因子) - - - - - - HPRD, BioGRID 10202154
HIPK2 DKFZp686K02111 | FLJ23711 | PRO0593 homeodomain相互作用蛋白激酶2 - - - - - - HPRD, BioGRID 11740489
HNF1A HNF1 | LFB1 | MODY3 | TCF1 HNF1同源框一个 海关与边境保护局与HNF-1基因。 绑定 15616580
HNF1A HNF1 | LFB1 | MODY3 | TCF1 HNF1同源框一个 - - - - - - HPRD, BioGRID 10777539
HNF4A FLJ39654 | HNF4 | HNF4a7 | HNF4a8 | HNF4a9 | MODY | MODY1 | NR2A1 | NR2A21 | TCF | TCF14 肝细胞的核因子4α 海关与边境保护局与HNF-4基因。 绑定 15616580
HNF4A FLJ39654 | HNF4 | HNF4a7 | HNF4a8 | HNF4a9 | MODY | MODY1 | NR2A1 | NR2A21 | TCF | TCF14 肝细胞的核因子4α - - - - - - HPRD, BioGRID 9434765|10085149
HOXB7 HHO。C1 | HOX2 | HOX2C | hox - 2.3 同源框B7 - - - - - - HPRD, BioGRID 10435624
HSF1 HSTF1 热休克转录因子1 HSF1与CBP交互。这种交互建模在展示人类HSF1和CBP从一个未指明的物种之间的相互作用。 绑定 14960326
计画 高清| IT15 杭丁顿蛋白 CBP与计画。这种交互建模在CBP和计画从不明物种之间的相互作用。 绑定 10823891
计画 高清| IT15 杭丁顿蛋白 - - - - - - HPRD, BioGRID 11264541
计画 高清| IT15 杭丁顿蛋白 计画与CBP交互。 绑定 15225551
ICAM1 BB2组| CD54 | P3.58 细胞间粘附分子1 CREBBP (CBP)与ICAM1启动子进行交互。 绑定 15829968
ING1 p24ING1c | p33 | p33ING1 | p33ING1b | p47 | p47ING1a 抑制增长的家庭,成员1 亲和力Capture-Western BioGRID 12015309
IRF3 - - - - - - 干扰素调节因子3 IRF-3与CBP交互。 绑定 15502848
IRF3 - - - - - - 干扰素调节因子3 - - - - - - HPRD, BioGRID 10521456
JDP2 JUNDM2 6月二聚蛋白2 - - - - - - HPRD 12101239
小君 AP-1 | AP1 | c-Jun 小君致癌基因 - - - - - - HPRD, BioGRID 2138276|9786917
KAT2B CAF P P / CAF | | | PCAF K(赖氨酸)乙酰转移酶2 b 亲和力Capture-Western
Co-fractionation
重新组成复杂
BioGRID 9710619|11864601
KHDRBS1 FLJ34027 | Sam68 | p62 KH域包含,RNA绑定,信号转导相关的1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12496368
KLF1 EKLF Kruppel-like因子1(红色的) 生化活动 BioGRID 11259590
KLF13 BTEB3 | FKLF2 | NSLP1 | RFLAT-1 | RFLAT1 Kruppel-like因子13 亲和力Capture-Western
生化活动
表型增强
BioGRID 11748222
KLF4 EZF | GKLF Kruppel-like因子4(内脏) - - - - - - HPRD, BioGRID 10666450
KLF5 BTEB2 | CKLF | IKLF Kruppel-like因子5(肠) - - - - - - HPRD, BioGRID 12682370
MGC71685 | c-MAF v-maf肌肉筋膜纤维肉瘤癌基因相同器官(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 11943779
MGC71685 | c-MAF v-maf肌肉筋膜纤维肉瘤癌基因相同器官(禽流感) 海关与边境保护局与c-Maf交互。这种交互建模在CBP之间的交互和c-Maf不明来源。 绑定 11943779
MAFG MGC13090 | MGC20149 v-maf肌肉筋膜纤维肉瘤癌基因同族体G(禽流感) - - - - - - HPRD 11154691
MAML1 KIAA0200 | Mam-1 | Mam1 mastermind-like 1(果蝇) - - - - - - HPRD, BioGRID 12050117
MBD2 DKFZp586O0821 | DMTase | NY-CO-41 methyl-CpG绑定域蛋白2 - - - - - - HPRD 12665568
MED21 SRB7 | SURB7 中介复杂单元21 亲和力Capture-Western BioGRID 9710619
管理 - - - - - - O-6-methylguanine-DNA甲基转移酶 - - - - - - HPRD, BioGRID 11564893
MLL 1 | CXXC7 | FLJ11783 | HRX | HTRX1 | KMT2A | MLL / GAS7 | MLL1A | TET1-MLL | TRX1 骨髓/淋巴或mixed-lineage白血病(trithorax同系物,果蝇) - - - - - - HPRD, BioGRID 11259575|12205094
MSX1 HOX7 | HYD1 msh同源框1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10215616|11115394
MYB Cmyb | c-myb | c-myb_CDS | efg v-myb成髓细胞瘤病毒致癌基因相同器官(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 12196545
MYBL2 B-MYB | BMYB | MGC15600 v-myb成髓细胞瘤病毒致癌基因相同器官(禽流感)——2 - - - - - - HPRD, BioGRID 11423988
MYOD1 抽水机MYF3 | MYOD | | bHLHc1 肌原性的分化1 亲和力Capture-Western
表型增强
重新组成复杂
BioGRID 9001254|11463815
MYOD1 抽水机MYF3 | MYOD | | bHLHc1 肌原性的分化1 - - - - - - HPRD 2176177|9238849
|11463815
N4BP2 B3BP | FLJ10680 | KIAA1413 NEDD4结合蛋白2 - - - - - - HPRD, BioGRID 12730195
NAP1L1 FLJ16112 | MGC23410 | MGC8688 | NAP1 | NAP1L | NRP 核小体组装蛋白质1 1 CREBBP (CBP)与NAP1L1 (NAP-1)。 绑定 11940655
NCOA1 F-SRC-1 | KAT13A | MGC129719 | MGC129720 | NCoA-1 | RIP160 | SRC-1 | SRC1 | bHLHe42 核受体共激活剂1 亲和力Capture-MS
生化活动
重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 11113179|11971985
|15027889
NCOA1 F-SRC-1 | KAT13A | MGC129719 | MGC129720 | NCoA-1 | RIP160 | SRC-1 | SRC1 | bHLHe42 核受体共激活剂1 - - - - - - HPRD 11003650|11113179
NCOA3 ACTR | AIB-1 | AIB1 | CAGH16 | CTG26 | KAT13B | MGC141848 | RAC3 | SRC3 | TNRC14 | TNRC16 | TRAM-1 | pCIP 核受体共激活剂3 亲和力Capture-MS
Co-fractionation
2台混合动力
BioGRID 11076796|11971985
NCOA3 ACTR | AIB-1 | AIB1 | CAGH16 | CTG26 | KAT13B | MGC141848 | RAC3 | SRC3 | TNRC14 | TNRC16 | TRAM-1 | pCIP 核受体共激活剂3 ACTR与CBP交互。这种交互建模在展示人类ACTR和CBP从一个未指明的物种之间的相互作用。 绑定 9267036
NCOA3 ACTR | AIB-1 | AIB1 | CAGH16 | CTG26 | KAT13B | MGC141848 | RAC3 | SRC3 | TNRC14 | TNRC16 | TRAM-1 | pCIP 核受体共激活剂3 SRC-3与CBP交互。这种交互是模仿了人类SRC-3和CBP从一个未指明的物种之间的相互作用。 绑定 15383283
NCOA3 ACTR | AIB-1 | AIB1 | CAGH16 | CTG26 | KAT13B | MGC141848 | RAC3 | SRC3 | TNRC14 | TNRC16 | TRAM-1 | pCIP 核受体共激活剂3 海关与边境保护局与TRAM-1交互。这种交互是仿照人类TRAM-1演示鼠标CBP和之间的相互作用。 绑定 9346901
NCOA3 ACTR | AIB-1 | AIB1 | CAGH16 | CTG26 | KAT13B | MGC141848 | RAC3 | SRC3 | TNRC14 | TNRC16 | TRAM-1 | pCIP 核受体共激活剂3 - - - - - - HPRD 9445475|11823864
NCOA6 AIB3 | ANTP | ASC2 | HOX1.1 | HOXA7 | KIAA0181 | NRC | PRIP | RAP250 | TRBP 核受体共激活剂6 重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 10567404|11158331
NEUROG1 又名| Math4C | NEUROD3 | bHLHa6 | ngn1 neurogenin 1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11239394
NFATC2 KIAA0611 | NFAT1 | NFATP 核转录因子激活t细胞,细胞质,calcineurin-dependent 2 - - - - - - HPRD, BioGRID 9625762
NFATC4 NF-ATc4 | NFAT3 核转录因子激活t细胞,细胞质,calcineurin-dependent 4 - - - - - - HPRD, BioGRID 11514544
NFE2 NF-E2 |下岗通知 核转录因子(erythroid-derived 2), 45 kda 亲和力Capture-Western
生化活动
重新组成复杂
BioGRID 11154691
NFE2L2 NRF2 核转录因子(erythroid-derived 2)——2 - - - - - - HPRD, BioGRID 11683914
NKX2-1 BCH |六氯| NK-2 | NKX2.1 | NKX2A | TEBP | TITF1 | TTF-1 | TTF1 NK2同源框1 2台混合动力 BioGRID 11076796
NLK DKFZp761G1211 | FLJ21033 nemo-like激酶 - - - - - - HPRD 14720327
NPAS2 FLJ23138 | MGC71151 | MOP4 | PASD4 | bHLHe9 神经元不是域蛋白2 重新组成复杂 BioGRID 14645221
NR3C1 GCCR | GCR | GR | GRL 核受体亚科3 C组,成员1(糖皮质激素受体) - - - - - - HPRD, BioGRID 9649342
NUP98 ADIR2 | NUP196 | NUP96 nucleoporin 98 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 9858599
ONECUT1 HNF-6 | HNF6 | HNF6A 一个削减同源框1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10811635
PAX5 BSAP 成对框5 海关与边境保护局与Pax5交互。 绑定 11799127
PELP1 HMX3 | MNAR | P160 脯氨酸、谷氨酸和亮氨酸丰富蛋白质1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11481323
PHOX2A ARIX | CFEOM2 | FEOM2 | MGC52227 | NCAM2 | PMX2A paired-like同源框2 - - - - - - HPRD, BioGRID 10644760
PIAS3 FLJ14651 | ZMIZ5 蛋白质抑制剂激活统计,3 亲和力Capture-Western BioGRID 14691252
PML 万立升| PP8675 | RNF71 | TRIM19 早幼粒细胞白血病 - - - - - - HPRD 10077561|10610177
|12142048|12234245
|12622724
PML 万立升| PP8675 | RNF71 | TRIM19 早幼粒细胞白血病 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 10077561|10610177
|12622724
POLR2A MGC75453 | POLR2 | POLRA | RPB1 | RPBh1 | RPO2 | RPOL2 | RpIILS | hRPB220 | hsRPB1 DNA聚合酶(RNA) II(导演)多肽,220 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 9710619
PPARG NR1C3 | PPARG1 | PPARG2 | PPARgamma 过氧物酶体proliferator-activated受体γ 重新组成复杂 BioGRID 10848596
PROX1 - - - - - - 普洛斯彼罗同源框1 - - - - - - HPRD 11943779
PTMA MGC104802 | TMSA prothymosinα - - - - - - HPRD, BioGRID 11897665
RBBP4 NURF55 | RBAP48 视网膜母细胞瘤结合蛋白4 - - - - - - HPRD, BioGRID 10866654
RBBP7 MGC138867 | MGC138868 | RbAp46 视网膜母细胞瘤结合蛋白7 重新组成复杂 BioGRID 10866654
RELA MGC131774 | NFKB3 | p65 v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 9548485
RELA MGC131774 | NFKB3 | p65 v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) 海关与边境保护局与p65交互。 绑定 9096323
RELA MGC131774 | NFKB3 | p65 v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) RELA (NF-kappaB p65)与CREBBP (CBP)。 绑定 16007092
RPA2 REPA2 | RPA32 复制蛋白A2, 32 kda 亲和力Capture-Western BioGRID 17525332
RPS6KA1 HU-1 | MAPKAPK1A | RSK | RSK1 核糖体蛋白S6激酶,90 kda,多肽1 - - - - - - HPRD 8756728
RPS6KA2 HU-2 | MAPKAPK1C | RSK | RSK3 | S6K-alpha | S6K-alpha2 | p90-RSK3 | pp90RSK3 核糖体蛋白S6激酶,90 kda,多肽2 亲和力Capture-Western BioGRID 8756728
RPS6KA3 CLS | HU-3 | ISPK-1 | MAPKAPK1B | MRX19 | RSK | RSK2 | S6K-alpha3 | p90-RSK2 | pp90RSK2 核糖体蛋白S6激酶,90 kda,多肽3 - - - - - - HPRD, BioGRID 11564891
SERTAD1 SEI1 | TRIP-Br1 舒达域包含1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12736710
SMAD1 BSP1 | JV4-1 | JV41 | MADH1 | MADR1 SMAD家庭成员1 亲和力Capture-Western BioGRID 10673036|11239394
SMAD2 JV18 | JV18-1 | MADH2 | MADR2 | MGC22139 | MGC34440 | hMAD-2 | hSMAD2 SMAD家庭成员2 海关与边境保护局与Smad2交互。这种交互建模在鼠标CBP之间的交互和Smad2从一个未指明的物种。 绑定 15750622
SMAD2 JV18 | JV18-1 | MADH2 | MADR2 | MGC22139 | MGC34440 | hMAD-2 | hSMAD2 SMAD家庭成员2 海关与边境保护局与Smad2交互。之间的交互是仿照了交互CBP物种和人类Smad2不详。 绑定 9679056
SMAD3 DKFZp586N0721 | DKFZp686J10186 | HSPC193 | HsT17436 | JV15-2 | MADH3 | MGC60396 SMAD家庭成员3 海关与边境保护局与Smad3交互。这种交互建模在鼠标CBP之间的交互和Smad3从一个未指明的物种。 绑定 15750622
SMARCA4 BAF190 |缺失| FLJ39786 | SNF2 | SNF2-BETA | SNF2L4 | SNF2LB | SWI2 | hSNF2b 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚科,成员4 表型增强 BioGRID 11003650
SMARCB1 BAF47 | INI1 | RDT | SNF5 | SNF5L1 | Sfh1p | Snr1 | hSNFS 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚b,成员1 亲和力Capture-Western
Co-fractionation
BioGRID 9710619
SNIP1 FLJ12553 | rp3 - 423 b22.3 | dJ423B22.2 1 Smad核相互作用的蛋白质 - - - - - - HPRD, BioGRID 10887155
SRCAP DOMO1 | EAF1 | FLJ44499 | KIAA0309 | SWR1 Snf2-related CREBBP激活蛋白 - - - - - - HPRD 10347196|11581372
SREBF1 SREBP-1c | SREBP1 | bHLHd1 固醇调节元件结合转录因子1 亲和力Capture-Western
西部
BioGRID 8918891
SREBF2 SREBP2 | bHLHd2 固醇调节元件结合转录因子2 - - - - - - HPRD, BioGRID 8918891
SRF MCM1 血清反应因子(c-fos血清反应元件结合转录因子) 亲和力Capture-Western BioGRID 12622724
SS18L1 佳洁士| KIAA0693 | LP2261 | MGC26711 | MGC78386 滑膜肉瘤易位18-like 1号染色体上的基因 - - - - - - HPRD, BioGRID 14716005
STAT1 DKFZp686B04100 | ISGF-3 | STAT91 信号传感器和转录激活91 kda Stat1-beta与CBP交互。 绑定 8986769
STAT1 DKFZp686B04100 | ISGF-3 | STAT91 信号传感器和转录激活91 kda Stat1-alpha与CBP交互。 绑定 8986769
STAT1 DKFZp686B04100 | ISGF-3 | STAT91 信号传感器和转录激活91 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 8986769
STAT2 ISGF-3 | MGC59816 | P113 | STAT113 信号传感器和转录激活113 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 8848048|10464260
STAT3 APRF | FLJ20882 |麻疹| MGC16063 信号传感器和转录激活3(急性期反应的因素) 亲和力Capture-Western BioGRID 11239394
STAT3 APRF | FLJ20882 |麻疹| MGC16063 信号传感器和转录激活3(急性期反应的因素) Stat3被CBP乙酰化。这种交互建模在展示人类Stat3和CBP从一个未指明的物种之间的相互作用。 绑定 15653507
STAT6 D12S1644 | IL-4-STAT | STAT6B | STAT6C 信号传感器和激活转录6日interleukin-4诱导 - - - - - - HPRD, BioGRID 10454341|11574547
TACC2 AZU-1 | ECTACC 改变,含蛋白质酸性卷曲螺旋2 TACC2与CBP交互。 绑定 14767476
TCF12 来| HTF4 | HsT17266 | bHLHb20 转录因子12 HEBa与CBP交互。这种交互建模在赫和CBP之间的互动。 绑定 15333839
TCF12 来| HTF4 | HsT17266 | bHLHb20 转录因子12 ”赫与CBP交互。 绑定 15333839
TCF3 ea2 | ITF1 | MGC129647 | MGC129648 | bHLHb21 转录因子3 (ea2免疫球蛋白增强器绑定因素E12汽油/ E47) - - - - - - HPRD, BioGRID 12435739
隔离 - - - - - - thymine-DNA糖基化酶 - - - - - - HPRD, BioGRID 11864601
TFF1 BCEI | D21S21 | HP1。一个| HPS2 | pNR-2 | pS2 三叶草因子1 海关与边境保护局与pS2。 绑定 10490106
TGS1 DKFZp762A163 | FLJ22995 | NCOA6IP | PIMT | PIPMT trimethylguanosine合成酶同族体(酵母) - - - - - - HPRD, BioGRID 11912212
TNFSF10 APO2L | Apo-2L | CD253 | TL2 | 肿瘤坏死因子(配体)总科,10个成员 海关与边境保护局与TNFSF10启动子进行交互。 绑定 15619633
TP53 FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 肿瘤蛋白质p53 - - - - - - HPRD, BioGRID 10848610|11782467
TP53 FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 肿瘤蛋白质p53 p53与CBP交互。这种交互建模在展示人类p53和CBP从一个未指明的物种之间的相互作用。 绑定 10823891
TRAM2 KIAA0057 易位相关膜蛋白2 - - - - - - HPRD 14612417
TRERF1 BCAR2 | FLJ21198 | HSA277276 |拉伯|一国- 139 d8.5 | trep - 132 | dJ139D8.5 转录调节因子1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11349124
远方 HsT17391 甲状腺激素受体关联4 - - - - - - HPRD, BioGRID 10454579
XRCC6 CTC75 | CTCBF | G22P1 | KU70 | ML8 | TLAA x射线在中国仓鼠细胞修复补充缺陷修复6 重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 9488450
YWHAH YWHA1 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,埃塔多肽 - - - - - - HPRD 11266503


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG细胞周期 128年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG WNT信号通路 151年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG NOTCH信号通路 47 35 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG TGFβ信号通路 86年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG ADHERENS结 75年 53 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG木菠萝STAT信号通路 155年 105年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG长期势差现象 70年 57 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG杀菌作用 102年 80年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG亨廷顿疾病 185年 109年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG通路在癌症 328年 259年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG肾细胞癌 70年 60 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG前列腺癌 89年 75年 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA RELA通路 16 12 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA埋头通路 24 20. 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA CARM ER通路 35 27 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA VDR通路 12 7 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA设置路径 11 6 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA IL7通路 17 14 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA PPARA通路 58 43 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA PITX2通路 15 15 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA NFAT通路 56 45 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA NTHI通路 24 20. 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA PML通路 17 12 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA TGFB通路 19 14 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA CARM1通路 13 11 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA WNT通路 26 24 所有SZGR 2.0基因通路
圣在PC12细胞分化途径 45 35 所有SZGR 2.0基因通路
PID SMAD2 3核通路 82年 63年 所有SZGR 2.0基因通路
PID HDAC CLASSIII通路 25 20. 所有SZGR 2.0基因通路
PID E2F通路 74年 48 所有SZGR 2.0基因通路
PID HIF2PATHWAY 34 29日 所有SZGR 2.0基因通路
PID MYC活性途径 79年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
PID PS1通路 46 39 所有SZGR 2.0基因通路
PID TCPTP通路 43 33 所有SZGR 2.0基因通路
PID HDAC抚慰心灵的途径 66年 50 所有SZGR 2.0基因通路
PID NFAT 3通路 54 47 所有SZGR 2.0基因通路
PID REG GR通路 82年 60 所有SZGR 2.0基因通路
PID FOXO通路 49 43 所有SZGR 2.0基因通路
PID AJDISS 2通道 48 38 所有SZGR 2.0基因通路
PID P53下游通路 137年 94年 所有SZGR 2.0基因通路
PID AR TF通路 53 38 所有SZGR 2.0基因通路
PID IFNG通路 40 34 所有SZGR 2.0基因通路
PID FOXM1通路 40 30. 所有SZGR 2.0基因通路
PID CMYB通路 84年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
PID视黄酸途径 30. 23 所有SZGR 2.0基因通路
PID刺猬GLI通路 48 35 所有SZGR 2.0基因通路
PID工具包通路 52 40 所有SZGR 2.0基因通路
PID HIF1 TFPATHWAY 66年 52 所有SZGR 2.0基因通路
PID P53监管途径 59 50 所有SZGR 2.0基因通路
PID 1 RB通路 65年 46 所有SZGR 2.0基因通路
PID HNF3A通路 44 29日 所有SZGR 2.0基因通路
PID他嘿通路 48 39 所有SZGR 2.0基因通路
PID IL12 STAT4通路 33 29日 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME发育生物学 396年 292年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME BMAL1时钟NPAS2激活生理表现 36 27 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME PPARA激活基因表达 104年 72年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME前切口转录和翻译 29日 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RORA基因激活生理表现 24 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME YAP1和WWTR1小胡子刺激基因表达 24 16 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME前切口表达和处理 44 24 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME NOTCH1胞内域调节转录 46 28 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME昼夜镇压ERBA牧师的表达式 23 16 所有SZGR 2.0基因通路
由NOTCH1 REACTOME信号 70年 46 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME调节缺氧诱导因子诱导的氧气 25 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME通用转录途径 352年 181年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME缺口通过转录途径 13 8 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME代谢脂质和脂蛋白 478年 302年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168年 115年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME TRAF6 IRF7激活介导的 30. 26 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME生物钟 53 40 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME因素参与巨核细胞和血小板的生产发展 132年 101年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME TRAF3依赖IRF激活途径 14 10 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME钻机我MDA5介导的诱导干扰素αβ通路 73年 57 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME转录调控的白色脂肪细胞的分化 72年 53 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过切口 103年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME止血 466年 331年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME先天免疫系统 279年 178年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME免疫系统 933年 616年 所有SZGR 2.0基因通路
BORCZUK恶性间皮瘤起来 305年 185年 所有SZGR 2.0基因通路
GARGALOVIC应对氧化磷脂蓝色 136年 80年 所有SZGR 2.0基因通路
KOKKINAKIS蛋氨酸剥夺48小时 128年 95年 所有SZGR 2.0基因通路
KOKKINAKIS蛋氨酸不足96小时 117年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
DN SCHLOSSER血清反应 712年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHEIDEREIT IKK相互作用的蛋白质 58 45 所有SZGR 2.0基因通路
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 855年 609年 所有SZGR 2.0基因通路
滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN 483年 336年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA乳腺癌点燃INT网络 101年 73年 所有SZGR 2.0基因通路
布伊泰尔特说光动力治疗压力 811年 508年 所有SZGR 2.0基因通路
洛佩兹MBD的目标 957年 597年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN 514年 330年 所有SZGR 2.0基因通路
史密斯叔目标了 145年 91年 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 555年 346年 所有SZGR 2.0基因通路
THEILGAARD中性粒细胞在皮肤伤口DN 225年 163年 所有SZGR 2.0基因通路
崔TCF21目标2 DN 830年 547年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病了布莱洛克的 1691年 1088年 所有SZGR 2.0基因通路
DAZARD应对紫外线这些DN 318年 220年 所有SZGR 2.0基因通路
DN KRASNOSELSKAYA ILF3目标 46 38 所有SZGR 2.0基因通路
DURCHDEWALD皮肤致癌DN 264年 168年 所有SZGR 2.0基因通路
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 393年 244年 所有SZGR 2.0基因通路
桑塞姆APC MYC目标 217年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
桑塞姆APC需要MYC的目标 210年 123年 所有SZGR 2.0基因通路
KYNG DNA损伤射线和紫外线辐射 88年 65年 所有SZGR 2.0基因通路
KYNG DNA损伤DN 195年 135年 所有SZGR 2.0基因通路
IWANAGA致癌的喀斯特 170年 107年 所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO肝癌了 973年 570年 所有SZGR 2.0基因通路
BONOME卵巢癌生存非最优减积 510年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
结肠癌年级了 871年 505年 所有SZGR 2.0基因通路
GRESHOCK癌症拷贝数 323年 240年 所有SZGR 2.0基因通路
罗马胰岛素的目标肌肉DN 204年 114年 所有SZGR 2.0基因通路
PLASARI TGFB1信号通过NFIC 1小时DN 106年 77年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 137 759年 765年 m8 hsa - mir - 137 UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG
mir - 153 996年 1002年 m8 hsa - mir - 153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
mir - 186 1079年 1085年 1 hsa - mir - 186 CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU
mir - 200 bc / 429 518年 525年 1、m8 hsa - mir - 200 b UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
hsa - mir - 200 c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa - mir - 429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
miR-23 737年 743年 1 hsa-miR-23a大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
hsa-miR-23b大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
miR-26 744年 750年 1 hsa-miR-26a大脑 UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
hsa-miR-26b深圳 UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
hsa-miR-26a大脑 UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
hsa-miR-26b深圳 UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
miR-30-3p 49 56 1、m8 hsa-miR-30a-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC
hsa-miR-30e-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC
mir - 330 634年 640年 m8 hsa - mir - 330大脑 GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA
mir - 361 645年 652年 1、m8 hsa - mir - 361大脑 UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC
mir - 376 c 734年 740年 m8 hsa - mir - 376 c AACAUAGAGGAAAUUCCACG
mir - 381 1018年 1024年 1 hsa - mir - 381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir - 410 1121年 1127年 1 hsa - mir - 410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
mir - 488 183年 189年 m8 hsa - mir - 488 CCCAGAUAAUGGCACUCUCAA
mir - 493 - 5 - p 923年 929年 m8 hsa - mir - 493 - 5 - p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
mir - 495 158年 164年 1 hsa - mir - 495大脑 AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU
hsa - mir - 495大脑 AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU
mir - 543 1098年 1104年 m8 hsa - mir - 543 AAACAUUCGCGGUGCACUUCU
hsa - mir - 543 AAACAUUCGCGGUGCACUUCU