基因页:crebl2
概括?
基因 | 1389 |
象征 | crebl2 |
同义词 | - |
描述 | cAMP响应元素结合蛋白像2 |
参考 | MIM:603476|HGNC:HGNC:2350|Ensembl:ENSG00000111269|HPRD:07541|Vega:Otthumg00000168704 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12p13 |
Pascal P值 | 0.209 |
Sherlock P值 | 0.663 |
胎儿β | -1.245 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG10878170 | 12 | 12764498 | crebl2 | 1.026E-4 | -0.717 | 0.028 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CREBL2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
UBFD1 | 0.95 | 0.95 |
ZNF436 | 0.94 | 0.95 |
KBTBD7 | 0.93 | 0.95 |
dis3 | 0.93 | 0.93 |
ARPC5 | 0.93 | 0.92 |
WDR82 | 0.93 | 0.95 |
HMG20A | 0.93 | 0.94 |
exoc2 | 0.93 | 0.94 |
WDR48 | 0.93 | 0.93 |
TMEM169 | 0.93 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.77 | -0.87 |
MT-CO2 | -0.75 | -0.87 |
AF347015.31 | -0.75 | -0.86 |
TSC22D4 | -0.74 | -0.80 |
C5orf53 | -0.73 | -0.76 |
S100B | -0.73 | -0.80 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.82 |
ifi27 | -0.72 | -0.84 |
HLA-F | -0.72 | -0.76 |
higd1b | -0.71 | -0.85 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Korkola Seminoma UP | 44 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rodrigues DCC目标DN | 121 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC2靶向 | 114 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
障碍癌复发正常样本 | 32 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LOH在CHR9Q中与LOH的Lindgren膀胱癌 | 116 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3 UP总缺氧 | 209 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim生发中心T助手 | 66 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 | 182 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Midbrain标记 | 82 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的甲基化 | 56 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 | 245 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹间皮瘤生存 | 11 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
萨森对促性腺营养蛋白的反应 | 91 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasson对Forskolin的反应 | 90 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |